RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597316.1

TRPM4-208, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily M member 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRPM4, Length 780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM4-208ENST00000597316 ERICH2A1L162 156 aa20.21■□□□□ 0.83
TRPM4-208ENST00000597316 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TRPM4-208ENST00000597316 CYTH3O43739 400 aa20.21■□□□□ 0.83
TRPM4-208ENST00000597316 CHRNA1P02708 482 aa20.21■□□□□ 0.83
TRPM4-208ENST00000597316 MRE11P49959 708 aa20.21■□□□□ 0.83
TRPM4-208ENST00000597316 NUCB1Q02818 461 aa20.21■□□□□ 0.83
TRPM4-208ENST00000597316 SEMA3FQ13275 785 aa20.21■□□□□ 0.83
TRPM4-208ENST00000597316 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.21■□□□□ 0.83
TRPM4-208ENST00000597316 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TRPM4-208ENST00000597316 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.21■□□□□ 0.83
TRPM4-208ENST00000597316 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.21■□□□□ 0.83
TRPM4-208ENST00000597316 GRM6O15303 877 aa20.2■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 GHRP10912 638 aa20.2■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 IRS1P35568 1242 aa20.2■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 SP4Q02446 784 aa20.2■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.2■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 RSPH3Q86UC2 560 aa20.2■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 FBXL18Q96ME1 805 aa20.2■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.2■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.2■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 COL4A6Q14031 1691 aa20.19■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 ENPP3O14638 875 aa20.19■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 NHLH1Q02575 133 aa20.19■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 HYAL1Q12794 435 aa20.19■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 NLRX1Q86UT6 975 aa20.19■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
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TRPM4-208ENST00000597316 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.19■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.19■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 MBTPS2O43462 519 aa20.18■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 LINC00271P0C7V0 271 aa20.18■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 TROAPQ12815 778 aa20.18■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 WTAPQ15007 396 aa20.18■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 CLUL1Q15846 466 aa20.18■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.18■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.18■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.18■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 PLVAPQ9BX97 442 aa20.18■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.18■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
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TRPM4-208ENST00000597316 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 LPIN1Q14693 890 aa20.17■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.17■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.17■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.17■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 IGFLR1Q9H665 355 aa20.17■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 IGHDP01880 384 aa20.16■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 MGAT3Q09327 533 aa20.16■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 PPFIA1Q13136 1202 aa20.16■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.16■□□□□ 0.82
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TRPM4-208ENST00000597316 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.16■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 CDHR1Q96JP9 859 aa20.16■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 IL25Q9H293 177 aa20.16■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 SENP2Q9HC62 589 aa20.16■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.16■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 MYH6P13533 1939 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 STXBP3O00186 592 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 DGKIO75912 1065 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 MMP1P03956 469 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 ADAM15Q13444 863 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 RNF135Q8IUD6 432 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 MUTYHQ9UIF7 546 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 CD207Q9UJ71 328 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 LAMA4Q16363 1823 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPM4-208ENST00000597316 PIK3CDO00329 1044 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 MEIS2O14770 477 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 CSPG5O95196 566 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 CYP21A2P08686 494 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 GRIK4Q16099 956 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 NCOA7Q8NI08 942 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 GLG1Q92896 1179 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 P2RX5Q93086 422 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 GPRASP2Q96D09 838 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 ATP9AO75110 1047 aa20.13■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 TBX10O75333 385 aa20.13■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 MARK3P27448 753 aa20.13■□□□□ 0.81
TRPM4-208ENST00000597316 NDUFV1P49821 464 aa20.13■□□□□ 0.81
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