RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550260.1

LARP4-215, Transcript of La ribonucleoprotein domain family member 4, human

TSL 3

Gene LARP4, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LARP4-215	ENST00000550260	PPP2CB	P62714	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	PPP2CA	P67775	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	OSBP2	Q969R2	916 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	FAH	P16930	419 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	GDF5	P43026	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	NTRK3	Q16288	839 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	WASF3	Q9UPY6	502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	PDPK1	O15530	556 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	ST5	P78524	1137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	PFKP	Q01813	784 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	MTERF2	Q49AM1	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	USP51	Q70EK9	711 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	IPPK	Q9H8X2	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	APP	P05067	770 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	TACR2	P21452	398 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	HMGA2	P52926	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	PAK1	Q13153	545 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	ICAM4	Q14773	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	SPATC1	Q76KD6	591 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	PTPN18	Q99952	460 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260		H0Y858	1186 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	AQP7	O14520	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	KRT15	P19012	456 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260		Q6ZUG5	572 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	VPS11	Q9H270	941 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LARP4-215	ENST00000550260	GSTA4	O15217	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LARP4-215	ENST00000550260	GPR42	O15529	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LARP4-215	ENST00000550260	CHGB	P05060	677 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LARP4-215	ENST00000550260	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68	5e-11	■■■■■ 66.1
LARP4-215	ENST00000550260	EPHB4	P54760	987 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LARP4-215	ENST00000550260	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LARP4-215	ENST00000550260	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LARP4-215	ENST00000550260	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LARP4-215	ENST00000550260	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LARP4-215	ENST00000550260	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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