RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 MOXD1Q6UVY6 613 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 TELO2Q9Y4R8 837 aa24.91■■□□□ 1.58
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PTPRK-222ENST00000532751 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 MFSD5Q6N075 450 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM199Q8N511 208 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 OXER1Q8TDS5 423 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 TMX3Q96JJ7 454 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 C8orf76Q96K31 380 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 AZI2Q9H6S1 392 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 ACTR2P61160 394 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 FPGSQ05932 587 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 Q4G0T1 1027 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 NEK8Q86SG6 692 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM50Q86XT4 487 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.89■■□□□ 1.58
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PTPRK-222ENST00000532751 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa24.88■■□□□ 1.57
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PTPRK-222ENST00000532751 CYP3A7P24462 503 aa24.88■■□□□ 1.57
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PTPRK-222ENST00000532751 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.87■■□□□ 1.57
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PTPRK-222ENST00000532751 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRK-222ENST00000532751 CYP2C18P33260 490 aa24.87■■□□□ 1.57
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PTPRK-222ENST00000532751 UIMC1Q96RL1 719 aa24.87■■□□□ 1.57
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PTPRK-222ENST00000532751 CAGE1Q8TC20 777 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRK-222ENST00000532751 TNFRSF25Q93038 417 aa24.85■■□□□ 1.57
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PTPRK-222ENST00000532751 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRK-222ENST00000532751 ABHD15Q6UXT9 468 aa24.84■■□□□ 1.57
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PTPRK-222ENST00000532751 SLC26A2P50443 739 aa24.83■■□□□ 1.57
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PTPRK-222ENST00000532751 PCYT2Q99447 389 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRK-222ENST00000532751 SAMM50Q9Y512 469 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRK-222ENST00000532751 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PTPRK-222ENST00000532751 NRCAMQ92823 1304 aa24.83■■□□□ 1.56
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PTPRK-222ENST00000532751 PSAPP07602 524 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 CSF2RAP15509 400 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 HOXC8P31273 242 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.82■■□□□ 1.56
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