RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495491.5

HCLS1-211, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,219 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-211ENST00000495491 RFXAPO00287 272 aa14.73□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 AMHP03971 560 aa14.73□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 FBXL16Q8N461 479 aa14.73□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.73□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 KCNB2Q92953 911 aa14.73□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 TOP1MTQ969P6 601 aa14.73□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.73□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 SUGCTQ9HAC7 445 aa14.73□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.73□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.73□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 NFASCO94856 1347 aa14.72□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.72□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.72□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 ATP9AO75110 1047 aa14.72□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 MTMR1Q13613 665 aa14.72□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 KRT32Q14532 448 aa14.72□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 TRIM50Q86XT4 487 aa14.72□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.72□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 NEK1Q96PY6 1258 aa14.72□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.72□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 SETD4Q9NVD3 440 aa14.72□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.72□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.72□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 SQORQ9Y6N5 450 aa14.72□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.71□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 PTPRSQ13332 1948 aa14.71□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.71□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.054e-10■■■■■ 30.9
HCLS1-211ENST00000495491 NIPA1Q7RTP0 329 aa14.71□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 HLA-CQ95604 372 aa14.71□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 CERS4Q9HA82 394 aa14.71□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.71□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.71□□□□□ -0.05
HCLS1-211ENST00000495491 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 SORBS3O60504 671 aa14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 CHRNA1P02708 482 aa14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 MGAT3Q09327 533 aa14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 AP3B2Q13367 1082 aa14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 COL19A1Q14993 1142 aa14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 SPRED2Q7Z698 418 aa14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 MICU3Q86XE3 530 aa14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 IL27Q8NEV9 243 aa14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 BARHL2Q9NY43 387 aa14.7□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 ESYT2A0FGR8 921 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 MEIS1O00470 390 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 ZBTB43O43298 467 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 ATG7O95352 703 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 RXRAP19793 462 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 SREBF1P36956 1147 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 SLC26A2P50443 739 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 ARHGAP4P98171 946 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 TFF2Q03403 129 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 PPFIA1Q13136 1202 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 RTN1Q16799 776 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 CEP55Q53EZ4 464 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 MCTP2Q6DN12 878 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 RSPH3Q86UC2 560 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 RASEFQ8IZ41 740 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 NID2Q14112 1375 aa14.69□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa14.68□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 STXBP3O00186 592 aa14.68□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 CDC45O75419 566 aa14.68□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 GRIK4Q16099 956 aa14.68□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 UBE2SQ16763 222 aa14.68□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 KRT40Q6A162 431 aa14.68□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.68□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 MICALL1Q8N3F8 863 aa14.68□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 PCYT2Q99447 389 aa14.68□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.68□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.68□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.68□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HCLS1-211ENST00000495491 SLC9A2Q9UBY0 812 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms