RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480996.1

KDM4C-208, Transcript of lysine demethylase 4C, human

TSL 3

Gene KDM4C, Length 405 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4C-208	ENST00000480996	PLS3	P13797	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	MTHFD2	P13995	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	IFNGR1	P15260	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TYRP1	P17643	537 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PAM	P19021	973 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CD40	P25942	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	NOS3	P29474	1203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	GRK3	P35626	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CACNB3	P54284	484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TERF2	Q15554	542 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	NACC1	Q96RE7	527 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TPP1	O14773	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	MSC	O60682	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	NBN	O60934	754 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	KRT37	O76014	449 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	FAM87A	P0C7U9	286 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SRF	P11831	508 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	VAV1	P15498	845 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PTMS	P20962	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC16A1	P53985	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TNK2	Q07912	1038 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	NFKBIB	Q15653	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	MMP19	Q99542	508 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	KDM1A	O60341	852 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	MGEA5	O60502	916 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ZNF205	O95201	554 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CYP17A1	P05093	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	LCP1	P13796	627 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SERPINB3	P29508	390 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC5A3	P53794	718 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	HTRA3	P83110	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	IRF9	Q00978	393 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ODF1	Q14990	250 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	DPP9	Q86TI2	863 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PDILT	Q8N807	584 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SP110	Q9HB58	689 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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