RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 GPRASP2Q96D09 838 aa22.12■■□□□ 1.13
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SHQ1-206ENST00000471526 ITGB5P18084 799 aa22.11■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 ADAM17P78536 824 aa22.11■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 CDHR1Q96JP9 859 aa22.11■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.11■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.11■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 PTPRSQ13332 1948 aa22.11■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 NRCAMQ92823 1304 aa22.1■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.1■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 KCNA2P16389 499 aa22.1■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 MARK3P27448 753 aa22.1■■□□□ 1.13
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SHQ1-206ENST00000471526 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.1■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 MICU3Q86XE3 530 aa22.1■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.1■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.1■■□□□ 1.13
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SHQ1-206ENST00000471526 COL9A1P20849 921 aa22.09■■□□□ 1.13
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SHQ1-206ENST00000471526 TOP1MTQ969P6 601 aa22.09■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.09■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.08■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 PPFIA1Q13136 1202 aa22.08■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 FAM26DQ5JW98 314 aa22.08■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.08■■□□□ 1.13
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SHQ1-206ENST00000471526 SKAP1Q86WV1 359 aa22.07■■□□□ 1.12
SHQ1-206ENST00000471526 APBB2Q92870 758 aa22.07■■□□□ 1.12
SHQ1-206ENST00000471526 JADE2Q9NQC1 790 aa22.07■■□□□ 1.12
SHQ1-206ENST00000471526 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.07■■□□□ 1.12
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SHQ1-206ENST00000471526 RNF20Q5VTR2 975 aa22.06■■□□□ 1.12
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SHQ1-206ENST00000471526 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.05■■□□□ 1.12
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SHQ1-206ENST00000471526 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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SHQ1-206ENST00000471526 AZI2Q9H6S1 392 aa22.02■■□□□ 1.12
SHQ1-206ENST00000471526 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.02■■□□□ 1.12
SHQ1-206ENST00000471526 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.02■■□□□ 1.12
SHQ1-206ENST00000471526 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.01■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 H3BNC9 293 aa22.01■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 ZBTB43O43298 467 aa22.01■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 ARP10275 920 aa22.01■■□□□ 1.11
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