RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 RNPEPQ9H4A4 650 aa27.02■■□□□ 1.92
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HOXB3-202ENST00000460160 PBX2P40425 430 aa27.01■■□□□ 1.91
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HOXB3-202ENST00000460160 SEPT1Q8WYJ6 367 aa27.01■■□□□ 1.91
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HOXB3-202ENST00000460160 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.99■■□□□ 1.91
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HOXB3-202ENST00000460160 ZNF576Q9H609 170 aa26.95■■□□□ 1.91
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HOXB3-202ENST00000460160 PPFIA1Q13136 1202 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-202ENST00000460160 GRIN2CQ14957 1233 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-202ENST00000460160 TCTN1Q2MV58 587 aa26.93■■□□□ 1.9
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HOXB3-202ENST00000460160 CIITAP33076 1130 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-202ENST00000460160 SETQ01105 290 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-202ENST00000460160 ANKRD1Q15327 319 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-202ENST00000460160 CNKSR3Q6P9H4 555 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-202ENST00000460160 MYLIPQ8WY64 445 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-202ENST00000460160 UIMC1Q96RL1 719 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-202ENST00000460160 PCDHA4Q9UN74 947 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-202ENST00000460160 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-202ENST00000460160 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-202ENST00000460160 CAND2O75155 1236 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-202ENST00000460160 ATG7O95352 703 aa26.91■■□□□ 1.9
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