RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 LTBP2Q14767 1821 aa20.47■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 TDP2O95551 362 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 MMP1P03956 469 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 CYP2C18P33260 490 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 MCM2P49736 904 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 ACTR2P61160 394 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 FPGSQ05932 587 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 KRT40Q6A162 431 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 MFSD5Q6N075 450 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 A0A1W2PPC1 479 aa20.45■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 DHX15O43143 795 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.45■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.45■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 NR5A1Q13285 461 aa20.45■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 TMEM199Q8N511 208 aa20.45■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.45■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 GLG1Q92896 1179 aa20.45■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 TMX3Q96JJ7 454 aa20.45■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.45■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 MSH4O15457 936 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 CCNE2O96020 404 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 CYP3A7P24462 503 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 CCL23P55773 120 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 LETM2Q2VYF4 491 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 Q4G0T1 1027 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 MOXD1Q6UVY6 613 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 NEK8Q86SG6 692 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 TDHQ8IZJ6 230 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 C8orf76Q96K31 380 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 PCYT2Q99447 389 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 EMSYQ7Z589 1322 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 BTBD18B2RXH4 712 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 LGR5O75473 907 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 MARK3P27448 753 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 EPHB4P54760 987 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 GUCY1B3Q02153 619 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 HIC1Q14526 733 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 TNFRSF25Q93038 417 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 MBOAT7Q96N66 472 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 WNT8AQ9H1J5 351 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 AZI2Q9H6S1 392 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 FAM205CA6NFA0 338 aa20.42■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 ATG7O95352 703 aa20.42■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 CSF2RAP15509 400 aa20.42■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 BFSP2Q13515 415 aa20.42■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.42■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 STAT5BP51692 787 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 KRT76Q01546 638 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 PTK7Q13308 1070 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 SHHQ15465 462 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 RETREG2Q8NC44 543 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 SLC5A5Q92911 643 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 GJA10Q969M2 543 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 SCLYQ96I15 445 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 SETD4Q9NVD3 440 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 PITPNM1O00562 1244 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 BACH1O14867 736 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 SLC37A4O43826 429 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 GAS7O60861 476 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 GNAT1P11488 350 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 HOXC8P31273 242 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 CAGE1Q8TC20 777 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 RIT2Q99578 217 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-205ENST00000426683 NRCAMQ92823 1304 aa20.39■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.39■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 TREHO43280 583 aa20.39■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 ACRP10323 421 aa20.39■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 PPFIA1Q13136 1202 aa20.39■□□□□ 0.85
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