RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418795.3

FAM27E3-201, Transcript of family with sequence similarity 27 member E3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM27E3, Length 1,593 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3-201ENST00000418795 LENG9Q96B70 501 aa14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 BACH2Q9BYV9 841 aa14.56□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 PRR16Q569H4 304 aa14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 OXER1Q8TDS5 423 aa14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 SLC9A2Q9UBY0 812 aa14.55□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 CCNE2O96020 404 aa14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 USP11P51784 963 aa14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 RABEP1Q15276 862 aa14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 TMEM199Q8N511 208 aa14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 WASF1Q92558 559 aa14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 VWCEQ96DN2 955 aa14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 SCLYQ96I15 445 aa14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 PCYT2Q99447 389 aa14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 SDF4Q9BRK5 362 aa14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 NOD1Q9Y239 953 aa14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 ACRP10323 421 aa14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 XBP1P17861 261 aa14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 HOXC8P31273 242 aa14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 ACTR2P61160 394 aa14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 WNT8BQ93098 351 aa14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 FOSBP53539 338 aa14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 INF2Q27J81 1249 aa14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 LRCH3Q96II8 777 aa14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3-201ENST00000418795 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 PITPNM1O00562 1244 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 MSH4O15457 936 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 LGR5O75473 907 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 ATG7O95352 703 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 TDP2O95551 362 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 CYP3A7P24462 503 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 MARK3P27448 753 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 NR5A1Q13285 461 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 TMEM240Q5SV17 173 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 TNFRSF25Q93038 417 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 GJA10Q969M2 543 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 IL23AQ9NPF7 189 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 SETD4Q9NVD3 440 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 EMSYQ7Z589 1322 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 SCN5AQ14524 2016 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 COL6A3P12111 3177 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 FAM205CA6NFA0 338 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 TREHO43280 583 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 IQCF3P0C7M6 154 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 ADAM17P78536 824 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 PTK7Q13308 1070 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 BFSP2Q13515 415 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 ZNF365Q70YC5 407 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 GLG1Q92896 1179 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 MBOAT7Q96N66 472 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 ST18O60284 1047 aa14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 MMP1P03956 469 aa14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 CKBP12277 381 aa14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 KRT2P35908 639 aa14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 RBL2Q08999 1139 aa14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 GPNMBQ14956 572 aa14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 Q4G0T1 1027 aa14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 KRT40Q6A162 431 aa14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 SERINC5Q86VE9 423 aa14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 CAGE1Q8TC20 777 aa14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 EYSQ5T1H1 3165 aa14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 BTBD18B2RXH4 712 aa14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3-201ENST00000418795 STAT5BP51692 787 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms