RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 IL9P15248 144 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 KCNA5P22460 613 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 ARHGAP4P98171 946 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 MGAT3Q09327 533 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 GNPTABQ3T906 1256 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 MARCH8Q5T0T0 291 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 SKAP1Q86WV1 359 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 RUFY2Q8WXA3 655 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 SEPT8Q92599 483 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 PCYT2Q99447 389 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 MAP3K14Q99558 947 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 SENP7Q9BQF6 1050 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 LRRC2Q9BYS8 371 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 COL19A1Q14993 1142 aa15.31■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 LEXMQ3ZCV2 418 aa15.31■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 TYW1BQ6NUM6 668 aa15.31■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa15.31■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 LINC01599Q8WXQ3 324 aa15.31■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.31■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 PKD2L1Q9P0L9 805 aa15.31■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa15.31■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 H3BNC9 293 aa15.3■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 SLC27A2O14975 620 aa15.3■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 CAND2O75155 1236 aa15.3■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 GHRP10912 638 aa15.3■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 MARK3P27448 753 aa15.3■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 SMARCA1P28370 1054 aa15.3■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 PLA2G5P39877 138 aa15.3■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 TRAF1Q13077 416 aa15.3■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 LPIN1Q14693 890 aa15.3■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 SART3Q15020 963 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM192Q8IY95 271 aa15.3■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 CYP2W1Q8TAV3 490 aa15.3■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 NEK9Q8TD19 979 aa15.3■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa15.3■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 H3BQ06 376 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 TCEAL5Q5H9L2 206 aa15.29■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 RPAINQ86UA6 219 aa15.29■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 FAM178BQ8IXR5 827 aa15.29■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 CCDC82Q8N4S0 544 aa15.29■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 GPRASP2Q96D09 838 aa15.29■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 YME1L1Q96TA2 773 aa15.29■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 NRCAMQ92823 1304 aa15.28■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 GRXCR2A6NFK2 248 aa15.28■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 LTBRP36941 435 aa15.28■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 FUT2Q10981 343 aa15.28■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 GPM6BQ13491 265 aa15.28■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 NECTIN1Q15223 517 aa15.28■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 GRIK4Q16099 956 aa15.28■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 XRRA1Q6P2D8 792 aa15.28■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 TMTC3Q6ZXV5 915 aa15.28■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 CRIPAKQ8N1N5 446 aa15.28■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 PSTPIP2Q9H939 334 aa15.28■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 NLRC5Q86WI3 1866 aa15.28■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 MUC6Q6W4X9 2439 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 POTEB3A0JP26 581 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 PI4K2BG5E9Z4 385 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 ENPP3O14638 875 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 ADAMTS3O15072 1205 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 GRM6O15303 877 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 KIF5BP33176 963 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 LIFRP42702 1097 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 PPFIA1Q13136 1202 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 CAMK1Q14012 370 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 FBXO47Q5MNV8 452 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 CREB3L3Q68CJ9 461 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 POTEBQ6S5H4 581 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 BANK1Q8NDB2 785 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 DNAJB3Q8WWF6 145 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 CUL5Q93034 780 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 PGBD1Q96JS3 809 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 MTA3Q9BTC8 594 aa15.27■□□□□ 0.04
CNGA3-202ENST00000393503 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.26■□□□□ 0.03
CNGA3-202ENST00000393503 GPR37L1O60883 481 aa15.26■□□□□ 0.03
CNGA3-202ENST00000393503 GNAT1P11488 350 aa15.26■□□□□ 0.03
CNGA3-202ENST00000393503 MCM5P33992 734 aa15.26■□□□□ 0.03
CNGA3-202ENST00000393503 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP15.26■□□□□ 0.03
CNGA3-202ENST00000393503 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
CNGA3-202ENST00000393503 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
CNGA3-202ENST00000393503 WWC2Q6AWC2 1192 aa15.26■□□□□ 0.03
CNGA3-202ENST00000393503 CASC1Q6TDU7 716 aa15.26■□□□□ 0.03
CNGA3-202ENST00000393503 NLRX1Q86UT6 975 aa15.26■□□□□ 0.03
CNGA3-202ENST00000393503 SEPT1Q8WYJ6 367 aa15.26■□□□□ 0.03
CNGA3-202ENST00000393503 APBB2Q92870 758 aa15.26■□□□□ 0.03
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
CNGA3-202ENST00000393503 LZTS2Q9BRK4 669 aa15.26■□□□□ 0.03
CNGA3-202ENST00000393503 JADE2Q9NQC1 790 aa15.26■□□□□ 0.03
CNGA3-202ENST00000393503 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms