RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 PTGISQ16647 500 aa25.03■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 TDHQ8IZJ6 230 aa25.03■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 HOXC8P31273 242 aa25.02■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 FPGSQ05932 587 aa25.02■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 UIMC1Q96RL1 719 aa25.02■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCYT2Q99447 389 aa25.02■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.02■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 WNT8AQ9H1J5 351 aa25.02■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa25.01■■□□□ 1.59
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IGHV3-20-201ENST00000390606 CCNE2O96020 404 aa25.01■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYP3A7P24462 503 aa25.01■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 ACTR2P61160 394 aa25.01■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 INF2Q27J81 1249 aa25.01■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 TNFRSF25Q93038 417 aa25.01■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATG7O95352 703 aa25■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 TDP2O95551 362 aa25■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa25■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 CSF2RAP15509 400 aa25■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 KRT40Q6A162 431 aa25■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 MOXD1Q6UVY6 613 aa25■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
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IGHV3-20-201ENST00000390606 RNPEPQ9H4A4 650 aa25■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 NOD1Q9Y239 953 aa25■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 EMSYQ7Z589 1322 aa25■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.99■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 MSH4O15457 936 aa24.99■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 MMP1P03956 469 aa24.99■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 KRT2P35908 639 aa24.99■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 FOSBP53539 338 aa24.99■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCL23P55773 120 aa24.99■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 NR5A1Q13285 461 aa24.99■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 SHHQ15465 462 aa24.99■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 Q4G0T1 1027 aa24.99■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 C9orf50Q5SZB4 431 aa24.99■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM199Q8N511 208 aa24.99■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMX3Q96JJ7 454 aa24.99■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D22BQ9NU19 505 aa24.99■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa24.98■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 C16orf59Q7L2K0 433 aa24.98■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa24.98■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa24.97■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.97■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM205CA6NFA0 338 aa24.97■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 PITPNM1O00562 1244 aa24.97■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADAM17P78536 824 aa24.97■■□□□ 1.59
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IGHV3-20-201ENST00000390606 ABHD15Q6UXT9 468 aa24.97■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 NEK8Q86SG6 692 aa24.97■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 GLG1Q92896 1179 aa24.97■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC5A5Q92911 643 aa24.97■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 WNT8BQ93098 351 aa24.97■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 VWCEQ96DN2 955 aa24.97■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 BRMS1Q9HCU9 246 aa24.97■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 SETD4Q9NVD3 440 aa24.97■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 ERAP1Q9NZ08 941 aa24.97■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 BTBD18B2RXH4 712 aa24.96■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 MARK3P27448 753 aa24.96■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 PTK7Q13308 1070 aa24.96■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 BFSP2Q13515 415 aa24.96■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM29Q14134 588 aa24.96■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 LETM2Q2VYF4 491 aa24.96■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 CAGE1Q8TC20 777 aa24.96■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 SCLYQ96I15 445 aa24.96■■□□□ 1.59
IGHV3-20-201ENST00000390606 MCM2P49736 904 aa24.95■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRIT3Q3SXY7 679 aa24.95■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa24.95■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 SERINC5Q86VE9 423 aa24.95■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 GJA10Q969M2 543 aa24.95■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 C8orf76Q96K31 380 aa24.95■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 RIT2Q99578 217 aa24.95■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 AZI2Q9H6S1 392 aa24.95■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 IL23AQ9NPF7 189 aa24.95■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 TREHO43280 583 aa24.94■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC37A4O43826 429 aa24.94■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 IQCF3P0C7M6 154 aa24.94■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 ACRP10323 421 aa24.94■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 STAT5BP51692 787 aa24.94■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 KRT76Q01546 638 aa24.94■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 GUCY1B3Q02153 619 aa24.94■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM240Q5SV17 173 aa24.94■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.94■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 ETNPPLQ8TBG4 499 aa24.94■■□□□ 1.58
IGHV3-20-201ENST00000390606 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.94■■□□□ 1.58
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