RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM87BQ96K49 555 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 SENP2Q9HC62 589 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYH6P13533 1939 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZP2Q05996 745 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 HOMER1Q86YM7 354 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 IL17RAQ96F46 866 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 LY9Q9HBG7 655 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 SETD4Q9NVD3 440 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 CLDND1Q9NY35 253 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 STAM2O75886 525 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 DDAH1O94760 285 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 TROAPQ12815 778 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 NEDD9Q14511 834 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 METTL7BQ6UX53 244 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 FIBCD1Q8N539 461 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNH6Q9H252 994 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC69A6NI79 296 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 RB1P06400 928 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 CTNNB1P35222 781 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMTC2Q8N394 836 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 ICAM3P32942 547 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 KRT32Q14532 448 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM26DQ5JW98 314 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 PIGSQ96S52 555 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPR20Q99678 358 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 COL4A6Q14031 1691 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 REC8O95072 547 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIF5BP33176 963 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARHGAP4P98171 946 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 RPAINQ86UA6 219 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 NEK1Q96PY6 1258 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAP3K14Q99558 947 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 FIBPO43427 364 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 CALM1P0DP23 149 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 CALM2P0DP24 149 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 CALM3P0DP25 149 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 BMPR1AP36894 532 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 LTBRP36941 435 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 LIFRP42702 1097 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 MRE11P49959 708 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYL10Q9BUA6 226 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 NRCAMQ92823 1304 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADAM17P78536 824 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 NHLH1Q02575 133 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIM50Q86XT4 487 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 FBXL18Q96ME1 805 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 GRM6O15303 877 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 IRS1P35568 1242 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 HYAL1Q12794 435 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 RASEFQ8IZ41 740 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHRNA1P02708 482 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 GHRP10912 638 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 GNAQP50148 359 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 SEMA3FQ13275 785 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 CLUL1Q15846 466 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 RSPH3Q86UC2 560 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-204ENST00000373166 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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