RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 COL20A1Q9P218 1284 aa11.35□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 MAP2K7O14733 419 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 MARCH6O60337 910 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 FAM160A1Q05DH4 1040 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 TMEM266Q2M3C6 531 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 ARHGEF16Q5VV41 709 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 FOXR1Q6PIV2 292 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 SLC30A10Q6XR72 485 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 BANK1Q8NDB2 785 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 DNERQ8NFT8 737 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 AK8Q96MA6 479 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 CLIC6Q96NY7 704 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 MTMR9Q96QG7 549 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 TAAR1Q96RJ0 339 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 RMDN3Q96TC7 470 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 RAB34Q9BZG1 259 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 CREBZFQ9NS37 354 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 VWA3AA6NCI4 1184 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 B4DLN1 442 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 CTAGE5O15320 804 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 CPP00450 1065 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 TM4SF4P48230 202 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 APLP1P51693 650 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 Q3C1V9 767 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 PCNX4Q63HM2 1172 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 SHC4Q6S5L8 630 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 NIPA1Q7RTP0 329 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 CCDC91Q7Z6B0 441 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 POTEDQ86YR6 584 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 IFNL1Q8IU54 200 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 FAM20AQ96MK3 541 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 CSRNP2Q9H175 543 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 PXMP2Q9NR77 195 aa11.34□□□□□ -0.59
GINS3-201ENST00000318129 SLC37A4O43826 429 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 URI1O94763 535 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 SETQ01105 290 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 PDIA5Q14554 519 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 KCTD2Q14681 263 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 FAM110CQ1W6H9 321 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 CEP55Q53EZ4 464 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 PRR16Q569H4 304 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 IWS1Q96ST2 819 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 KCNMB3Q9NPA1 279 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 DONSONQ9NYP3 566 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 A0A1B0GVL5 298 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 RASSF10A6NK89 507 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 POTEB2H3BUK9 544 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 CCP110O43303 1012 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 KINO60870 393 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 STAM2O75886 525 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 FCER1AP12319 257 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 CCND2P30279 289 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 TXLNAP40222 546 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 NOGQ13253 232 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 PGM5Q15124 567 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 E2F4Q16254 413 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 IL17AQ16552 155 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 DEFB115Q30KQ5 88 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 EP400NLQ6ZTU2 488 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 ENGASEQ8NFI3 743 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 MXRA8Q9BRK3 442 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 PDCD2LQ9BRP1 358 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 CXorf56Q9H5V9 222 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 HPSEQ9Y251 543 aa11.33□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 FAM86B1E9PN63 330 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 MEIS1O00470 390 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 STRNO43815 780 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 PEX10O60683 326 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 SMC2O95347 1197 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 ALDH1A1P00352 501 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 PFKFB1P16118 471 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 TXKP42681 527 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 SYKP43405 635 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 LONRF2Q1L5Z9 754 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 ABRAQ8N0Z2 381 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 CEP89Q96ST8 783 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 MMP19Q99542 508 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 ANO10Q9NW15 660 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 KCNG1Q9UIX4 513 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 KCNH3Q9ULD8 1083 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 STK24Q9Y6E0 443 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 SLC26A4O43511 780 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS3-201ENST00000318129 NR3C2P08235 984 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms