RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 ATP9AO75110 1047 aa22.53■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 ADAM17P78536 824 aa22.53■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGAP4P98171 946 aa22.53■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 UBE2SQ16763 222 aa22.53■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.53■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.53■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 HLA-CQ95604 372 aa22.53■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 CDHR1Q96JP9 859 aa22.53■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 SIP14410 1827 aa22.52■■□□□ 1.2
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CXCL3-201ENST00000296026 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.52■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 MICU3Q86XE3 530 aa22.52■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 NRCAMQ92823 1304 aa22.52■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.51■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
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CXCL3-201ENST00000296026 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.51■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.51■■□□□ 1.19
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CXCL3-201ENST00000296026 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.51■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.51■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.5■■□□□ 1.19
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CXCL3-201ENST00000296026 FAM26DQ5JW98 314 aa22.5■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 RNF20Q5VTR2 975 aa22.5■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.5■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.5■■□□□ 1.19
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CXCL3-201ENST00000296026 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.49■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
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CXCL3-201ENST00000296026 TOP1MTQ969P6 601 aa22.49■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 NEK1Q96PY6 1258 aa22.49■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 UPP2O95045 317 aa22.48■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 MARK3P27448 753 aa22.48■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 PPFIA1Q13136 1202 aa22.48■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 APOA5Q6Q788 366 aa22.48■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.48■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 SKAP1Q86WV1 359 aa22.48■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 GLG1Q92896 1179 aa22.48■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 YME1L1Q96TA2 773 aa22.48■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 JADE2Q9NQC1 790 aa22.48■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.48■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 KAT6AQ92794 2004 aa22.47■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 MAFGO15525 162 aa22.47■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 CHRNA1P02708 482 aa22.47■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.47■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.47■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.47■■□□□ 1.19
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CXCL3-201ENST00000296026 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.47■■□□□ 1.19
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CXCL3-201ENST00000296026 RPAINQ86UA6 219 aa22.46■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.46■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.46■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.46■■□□□ 1.19
CXCL3-201ENST00000296026 NAPAP54920 295 aa22.45■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 EPC2Q52LR7 807 aa22.45■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.45■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 RSPH3Q86UC2 560 aa22.45■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 SAMD11Q96NU1 681 aa22.45■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.45■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.45■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.45■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 ZBTB43O43298 467 aa22.44■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 GHRP10912 638 aa22.44■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 COL9A1P20849 921 aa22.44■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 RTN1Q16799 776 aa22.44■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
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CXCL3-201ENST00000296026 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.44■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.44■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 MUC3AQ02505 3323 aa22.44■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 IGBP1P78318 339 aa22.43■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 MGAT3Q09327 533 aa22.43■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 FUT2Q10981 343 aa22.43■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 LPIN1Q14693 890 aa22.43■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.43■■□□□ 1.18
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CXCL3-201ENST00000296026 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.43■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 RASEFQ8IZ41 740 aa22.43■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.43■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 PCYT2Q99447 389 aa22.43■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.42■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 COL4A6Q14031 1691 aa22.42■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 INSRRP14616 1297 aa22.42■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 ADCY7P51828 1080 aa22.42■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.42■■□□□ 1.18
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