RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W TAF14P35189 244 aa9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W COS111P38308 924 aa9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W IME4P41833 600 aa9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W YJL049WP47048 450 aa9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W AIM22P47051 409 aa9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W HMS2P47175 358 aa9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W PRP24P49960 444 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W DBP6P53734 629 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W TRM112P53738 135 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W DLT1Q04216 342 aa9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W SEG1Q04279 960 aa9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W YLR012CQ07927 99 aa9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W MHT1Q12525 324 aa9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W KAR1P11927 433 aa9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W PPH22P23595 377 aa9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W RER1P25560 188 aa9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W SFP1P32432 683 aa9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W TIP20P33891 701 aa9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W JEN1P36035 616 aa9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YBR284WP38150 797 aa9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W APM3P38153 483 aa9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W LEM3P42838 414 aa9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W ALB1P47019 175 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W APS3P47064 194 aa9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W MPC1P53157 130 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W GOR1P53839 350 aa9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YNL143CP53908 130 aa9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W MRPS16Q02608 121 aa9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W PIR3Q03180 325 aa9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W NGL2Q03264 515 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W ATG38Q05789 226 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YLR446WQ06204 433 aa9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YLR031WQ07978 186 aa9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W RTT10Q08924 1013 aa9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W LAT1P12695 482 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W LIP5P32875 414 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W APE3P37302 537 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YBR225WP38321 900 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YHR020WP38708 688 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W SBE22P38814 852 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W MDM31P38880 579 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YFL066CP43538 392 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YAE1P47118 141 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W NBP35P52920 328 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W NUP116Q02630 1113 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W AIM36Q03798 255 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W PHO92Q06390 306 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W SGV1P23293 657 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W DBP2P24783 546 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W MRPL9P31334 269 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W MET22P32179 357 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W KAP122P32767 1081 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W RSM22P36056 628 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W NVJ1P38881 321 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W SSU1P41930 458 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W GAT1P43574 510 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W SIP4P46954 829 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W MDE1P47095 244 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W CSN12P47130 423 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W STE24P47154 453 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YJR124CP47159 448 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W COX20Q04935 205 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W RSC3Q06639 885 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W ASR1Q06834 288 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W IRC10Q08118 586 aa9.88□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W AI3P03877 415 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W CDC21P06785 304 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W RED1P14291 827 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W MRPL8P22353 238 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W FPS1P23900 669 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W DBP1P24784 617 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W ARE1P25628 610 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W OAC1P32332 324 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W HYM1P32464 399 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W PEP7P32609 515 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W LEU5P38702 357 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W EXO1P39875 702 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W GDI1P39958 451 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W LAS21P40367 830 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W HXT9P40885 567 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W GDS1P41913 522 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W IRC7P43623 340 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W BPL1P48445 690 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W IPI3P53877 555 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W LSM7P53905 115 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W HER2Q03557 464 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W SPO77Q06134 477 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W VPS74Q06385 345 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YOR238WQ08634 303 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YDL109CQ12103 647 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W SFM1Q12314 213 aa9.87□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W AI4P03878 556 aa9.86□□□□□ -0.83
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