RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W RNR3P21672 869 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YHR182WP38870 785 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ARC35P53731 342 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W MDM32Q12171 622 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W GAL7P08431 366 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W EPT1P22140 391 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SUA7P29055 345 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W MRPL16P38064 232 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YJR098CP47139 656 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W UPF3P48412 387 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W EBS1Q03466 884 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ATG38Q05789 226 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SRP101P32916 621 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W LNP1P38878 278 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W HXT6P39003 570 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RPH1P39956 796 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W PHB1P40961 287 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YAP1802P53309 568 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W HED1Q03937 162 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ERB1Q04660 807 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YLR346CQ06139 101 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W IRC23Q08416 157 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RDR1Q08904 546 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TY1A-DR6P0CX70 440 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TY1A-ER1P0CX71 440 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TY1A-LR2P0CX72 440 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TY1A-PLP0CX73 440 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TY1A-JR1P0CX74 440 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TY1A-LR3P0CX75 440 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TY1A-ML2P0CX76 440 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ADH4P10127 382 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W CBS1P14066 229 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YCR051WP25631 222 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W IBA57P47158 497 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YDL183CP48569 320 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W BRO1P48582 844 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W CTR1P49573 406 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W VPS75P53853 264 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YDR239CQ03780 787 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W STP3Q05937 343 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ARV1Q06541 321 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TY1A-GR1Q12085 440 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W UPC2Q12151 913 aa2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W PDE2P06776 526 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W VPS21P36017 210 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YKR073CP36153 106 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W HXT7P39004 570 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W BUD22Q04347 519 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ETT1Q08421 412 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YLR049CQ12110 428 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YOR338WQ99326 363 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W HNM1P19807 563 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W HXT3P32466 567 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W CTF13P35203 478 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W HAS1Q03532 505 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W PLB2Q03674 706 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YHR214C-DP0CX93 97 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W MIG1P27705 504 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TPO5P36029 618 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ZTA1P38230 334 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W CYC2P38909 366 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RGI2P40188 164 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SOK2P53438 785 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W NOP12Q08208 459 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W DCI1Q08558 271 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W AMD1P15274 810 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W EST1P17214 699 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ERG9P29704 444 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W MAE1P36013 669 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W MDV1P47025 714 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YNR040WP53736 256 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data2.73□□□□□ -1.97 RIP-Chip
SIN3YOL004W IRC25Q07951 179 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W AFI1Q99222 893 aa2.73□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data2.72□□□□□ -1.97not detected
SIN3YOL004W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W BUB3P26449 341 aa2.72□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ERG3P32353 365 aa2.72□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YEL043WP32618 956 aa2.72□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YUH1P35127 236 aa2.72□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W PZF1P39933 429 aa2.72□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W EMC2P47133 292 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YGR111WP53265 400 aa2.72□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ATC1Q04005 294 aa2.72□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RBS1Q05672 457 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SKS1Q12505 502 aa2.72□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W LEU4P06208 619 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ERG20P08524 352 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
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