RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	HMX1	P32339	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	RGT1	P32862	1170 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	FLO10	P36170	1169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	ERG7	P38604	731 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	STP2	P38704	541 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	UBP5	P39944	805 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	FAU1	P40099	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	VRG4	P40107	337 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	IRC7	P43623	340 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YGL114W	P53134	725 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	GPI1	P53306	609 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	YNL146W	P53906	100 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	STD1	Q02794	444 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	FMP30	Q02883	468 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	AAD15	Q08361	143 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS0B	YLR048W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	DST1	P07273	309 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	HXT2	P23585	541 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	GID7	P25569	745 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	PPZ1	P26570	692 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	SPT10	P35208	640 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	SWC5	P38326	303 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	PEX18	P38855	283 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	YHR177W	P38867	453 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	ALP1	P38971	573 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	YAL037W	P39728	267 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	SPG5	P42933	373 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	NUP100	Q02629	959 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	URH1	Q04179	340 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	CAC2	Q04199	468 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	IVY1	Q04934	453 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	GLO2	Q05584	274 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	DIC1	Q06143	298 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	RNH203	Q12338	110 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	RMD5	Q12508	421 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	UGA1	P17649	471 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	SEC62	P21825	274 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	SPO11	P23179	398 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	BUB3	P26449	341 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	OAR1	P35731	278 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	MOH1	P38191	138 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	LEU5	P38702	357 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	BZZ1	P38822	633 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
RPS0B	YLR048W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	SPO19	Q03029	223 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	NUP53	Q03790	475 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	CAB5	Q03941	241 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	URC2	Q04411	772 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	ECM7	Q06200	448 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	REX4	Q08237	289 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
RPS0B	YLR048W	ATG34	Q12292	412 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	RKM5	Q12367	367 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	RRI1	Q12468	440 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	YCR007C	P25354	239 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	CTR86	P25355	563 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	YKL070W	P36087	169 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	MRPL37	P36532	105 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	HSM3	P38348	480 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	YHR122W	P38829	231 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	SNL1	P40548	159 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	IAH1	P41734	238 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	PCP1	P53259	346 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.5	□□□□□ -1.69	not detected
RPS0B	YLR048W	SLD5	Q03406	294 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	ERV41	Q04651	352 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	ARR1	Q06596	294 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	FRE7	Q12333	620 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	COQ3	P27680	312 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	MSK1	P32048	576 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	COY1	P34237	679 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	HOT13	P36078	116 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	ATM1	P40416	690 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.49	□□□□□ -1.69	RIP-Chip
RPS0B	YLR048W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	GTO1	P48239	356 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RPS0B	YLR048W	MND1	P53102	219 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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