RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W SDH8P38345 138 aa4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W OSH3P38713 996 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W MSR1P38714 643 aa4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W UIP3P39547 235 aa4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SAP1P39955 897 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W GET2P40056 285 aa4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W VHS2P40463 436 aa4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W CIN1P40987 1014 aa4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W DPB11P47027 764 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W MND1P53102 219 aa4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W EFM5P53200 248 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SPC98P53540 846 aa4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W UTP6Q02354 440 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W MFM1Q02783 413 aa4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W WAR1Q03631 944 aa4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W DCS1Q06151 350 aa4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W PIG1Q06216 648 aa4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SIL1Q08199 421 aa4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SLK19Q08581 821 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W PRS5Q12265 496 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W TEL1P38110 2787 aa4.01□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W CAR1P00812 333 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W RPL24AP04449 155 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W RNR2P09938 399 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SCH9P11792 824 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W MRP13P12686 339 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W CDC23P16522 626 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SAR1P20606 190 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W IMG1P25626 169 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W RPL5P26321 297 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W MSS51P32335 436 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W RIM1P32445 135 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W PHO11P35842 467 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W MYO3P36006 1272 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W LHS1P36016 881 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W DRE2P36152 348 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W MNN2P38069 597 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W ICS2P38284 255 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W MSG5P38590 489 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W PHO12P38693 467 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SIP3P38717 1229 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W RFX1P48743 811 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W ASN2P49090 572 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W MPS2P53159 387 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W YGR079WP53249 370 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W VOA1P53262 265 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W PGA2P53903 129 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SPO19Q03029 223 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W YDR541CQ03049 344 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SNZ1Q03148 297 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W ERV41Q04651 352 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W RRN11Q04712 507 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W NDL1Q06568 189 aa4□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W LEU4P06208 619 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W PET111P08468 800 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W ERG11P10614 530 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W GAL3P13045 520 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W PMR1P13586 950 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W ASF2P32448 525 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W ECM25P32525 599 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W RPT5P33297 434 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W HIS7P33734 552 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W BMH2P34730 273 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W YKR015CP36111 568 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W NTR2P36118 322 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W RPF2P36160 344 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W TVP38P36164 337 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W RIX1P38883 763 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SWP82P43554 623 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W TOM22P49334 152 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W YIP5P53108 310 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W MTL1P53214 551 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W APC4Q04601 652 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SMA2Q04658 369 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SMD2Q06217 110 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W YPR078CQ06813 372 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W ETT1Q08421 412 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W YOL107WQ12239 342 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W VAM3Q12241 283 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W INP53Q12271 1107 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W NDJ1Q12366 352 aa3.99□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W YPR089WO13585 888 aa3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W GPH1P06738 902 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W KGD2P19262 463 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SAG1P20840 650 aa3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W PUP3P25451 205 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W HIR2P32480 875 aa3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W KAP104P38217 918 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SWC5P38326 303 aa3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W HMF1P40037 129 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W MMF1P40185 145 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W AIM20P40451 204 aa3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SAD1P43589 448 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.1 ms