RNA–Protein interactions for RNA: YHR213W

YHR213W, Transcript of Pseudogenic fragment with similarity to flocculins, yeastyeast

Gene YHR213W, Length 597 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR213WYHR213W PXA2P34230 853 aa2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W SWH1P35845 1188 aa2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W OPY1P38271 328 aa2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W CAJ1P39101 391 aa2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W VPS52P39904 641 aa2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data2.9□□□□□ -1.95not detected
YHR213WYHR213W RTT101P47050 842 aa2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W TWF1P53250 332 aa2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W DRN1P53255 507 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W MRPL19P53875 158 aa2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W ATG29Q12092 213 aa2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W SCM3Q12334 223 aa2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W SET6Q12529 373 aa2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W SEC39Q12745 709 aa2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W GSC2P40989 1895 aa2.9□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W SAM1P10659 382 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W UTR4P32626 227 aa2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W PTR2P32901 601 aa2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W SIP2P34164 415 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W BMH2P34730 273 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W DUG2P38149 878 aa2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W TCM62P38228 572 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W RXT2P38255 430 aa2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W VID24P38263 362 aa2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W RPH1P39956 796 aa2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W MET18P40469 1032 aa2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W SPG5P42933 373 aa2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W EPL1P43572 832 aa2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W FMS1P50264 508 aa2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W COS10P52924 374 aa2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W GPI1P53306 609 aa2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W SLD5Q03406 294 aa2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W SPH1Q06160 661 aa2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W LSP1Q12230 341 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W SUC2P00724 532 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W EXO70P19658 623 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W GPI10P30777 616 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W NDC1P32500 655 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W FRE1P32791 686 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W MSN2P33748 704 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W MCR1P36060 302 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W CMC1P36064 111 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W MRPL4P36517 319 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W FAA2P39518 744 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W MBB1P39534 108 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W GPI8P49018 411 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W YML6P51998 286 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W LIF1P53150 421 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W ZPR1P53303 486 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W PHO92Q06390 306 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W SUE1Q06524 206 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W YDL009CQ12210 107 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W CEX1Q12453 761 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W VPS13Q07878 3144 aa2.88□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W MET17P06106 444 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W RED1P14291 827 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W AMD1P15274 810 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W CKA1P15790 372 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W ROX1P25042 368 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W LDB16P25587 256 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W VPH1P32563 840 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W NPL6P32832 435 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W SEC66P33754 206 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W OTU2P38747 307 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W NDT80P38830 627 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W SEC27P41811 889 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W HXT14P42833 540 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W OCA1P50946 238 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W YGL138CP53122 345 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W RET3P53600 189 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W JJJ1P53863 590 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W BNI5P53890 448 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W VPS9P54787 451 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W RLI1Q03195 608 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W ADD37Q03233 198 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W TLG1Q03322 224 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W TAF11Q04226 346 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W VPS20Q04272 221 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W RBS1Q05672 457 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W BNA5Q05979 453 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W VPS74Q06385 345 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W SYO1Q07395 620 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W HSP42Q12329 375 aa2.87□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W MES1P00958 751 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W MCK1P21965 375 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W AGA1P32323 725 aa2.86□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W VMA8P32610 256 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W PMT1P33775 817 aa2.86□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W PRX1P34227 261 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W CBP4P37267 147 aa2.86□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W SMF1P38925 575 aa2.86□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W POP1P41812 875 aa2.86□□□□□ -1.95
YHR213WYHR213W ELP2P42935 788 aa2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.4 ms