RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617062.4

CU633904.1-201, humanhuman

TSL 5

Gene CU633904.1, Length 560 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633904.1-201ENST00000617062 SEMA3FQ13275 785 aa10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 PTK7Q13308 1070 aa10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 MFSD10Q14728 455 aa10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 PTGISQ16647 500 aa10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 HSDL1Q3SXM5 330 aa10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 PPP1R18Q6NYC8 613 aa10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 NFXL1Q6ZNB6 911 aa10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 CUL5Q93034 780 aa10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 CDHR1Q96JP9 859 aa10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 SPATA33Q96N06 139 aa10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 NEK1Q96PY6 1258 aa10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 C16orf70Q9BSU1 422 aa10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 MYL10Q9BUA6 226 aa10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 PTPRSQ13332 1948 aa10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 DOCK5Q9H7D0 1870 aa10.13□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 KAT6AQ92794 2004 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 CAND2O75155 1236 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 SELPP16109 830 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 FUT2Q10981 343 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 KIAA0753Q2KHM9 967 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 FAM47CQ5HY64 1035 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 FCHSD1Q86WN1 690 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 C7orf31Q8N865 590 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 RETREG2Q8NC44 543 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 GPRASP2Q96D09 838 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 SCLYQ96I15 445 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 SLC9A7Q96T83 725 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 USP26Q9BXU7 913 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 GLT8D2Q9H1C3 349 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 PSTPIP2Q9H939 334 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 HDAC6Q9UBN7 1215 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 MSRAQ9UJ68 235 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 NOD1Q9Y239 953 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa10.12□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 MICAL3Q7RTP6 2002 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 MAFGO15525 162 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 EFCAB14O75071 495 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 ZNF286BP0CG31 522 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 FOSL2P15408 326 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 GPNMBQ14956 572 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 GRIN2CQ14957 1233 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 TRAF7Q6Q0C0 670 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 USP17L6PQ6QN14 398 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 LRRC8DQ7L1W4 858 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 OTOP2Q7RTS6 562 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 NLRX1Q86UT6 975 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 SERINC5Q86VE9 423 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 MICU3Q86XE3 530 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 MYLIPQ8WY64 445 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 FAM161BQ96MY7 647 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 GPR20Q99678 358 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 AGXT2Q9BYV1 514 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 MLXIPQ9HAP2 919 aa10.11□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 EMSYQ7Z589 1322 aa10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 BDP1A6H8Y1 2624 aa10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 COL4A6Q14031 1691 aa10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 H3BRB1 525 aa10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 ZBTB43O43298 467 aa10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 FOSP01100 380 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 LGALS2P05162 132 aa10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 CKBP12277 381 aa10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 KCNA2P16389 499 aa10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 HSPA4P34932 840 aa10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 PBX2P40425 430 aa10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 RTN1Q16799 776 aa10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 ADCK5Q3MIX3 580 aa10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 RPAINQ86UA6 219 aa10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 LRRC2Q9BYS8 371 aa10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 EHMT1Q9H9B1 1298 aa10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa10.1□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa10.09□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa10.09□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 GRXCR1A8MXD5 290 aa10.09□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 NOP56O00567 594 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 REC8O95072 547 aa10.09□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 GNAT1P11488 350 aa10.09□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 ITGB5P18084 799 aa10.09□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 RXRAP19793 462 aa10.09□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 EVCP57679 992 aa10.09□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 ADAM17P78536 824 aa10.09□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 AP3B2Q13367 1082 aa10.09□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 WWC2Q6AWC2 1192 aa10.09□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 CNKSR3Q6P9H4 555 aa10.09□□□□□ -0.79
CU633904.1-201ENST00000617062 SKAP1Q86WV1 359 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms