RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597552.1

TIMM50-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM50, Length 369 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-208ENST00000597552 LAMC2Q13753 1193 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 MFSD10Q14728 455 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 PTGISQ16647 500 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 DGKDQ16760 1214 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 KIAA0753Q2KHM9 967 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 TSGA10IPQ3SY00 556 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 KRT40Q6A162 431 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 Q6ZUG5 572 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 CYFIP1Q7L576 1253 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 SAMD3Q8N6K7 520 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 CUL5Q93034 780 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 WNT8BQ93098 351 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 LZTS2Q9BRK4 669 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 EPHX3Q9H6B9 360 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 NOD1Q9Y239 953 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 PIK3CDO00329 1044 aa11.5□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 ADAMTS3O15072 1205 aa11.5□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 F2P00734 622 aa11.5□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa11.5□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 SMARCA1P28370 1054 aa11.5□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 KRT32Q14532 448 aa11.5□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 TRIM50Q86XT4 487 aa11.5□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 KCNB2Q92953 911 aa11.5□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 BRF1Q92994 677 aa11.5□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 LRFN3Q9BTN0 628 aa11.5□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 PSTPIP2Q9H939 334 aa11.5□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 MLXIPQ9HAP2 919 aa11.5□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 EPOPA6NHQ4 379 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 STXBP3O00186 592 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 HAS3O00219 553 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 ADD1P35611 737 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 NAPAP54920 295 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 FGD1P98174 961 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 GNPTABQ3T906 1256 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 PCNX4Q63HM2 1172 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 C7orf31Q8N865 590 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 ARNTL2Q8WYA1 636 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 C16orf70Q9BSU1 422 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 TMEM260Q9NX78 707 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 V9GY48 417 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 TRANK1O15050 2925 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 FIBPO43427 364 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 TLL1O43897 1013 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 ATP9AO75110 1047 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 ARHGEF15O94989 841 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 LGALS2P05162 132 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 PFKMP08237 780 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 IQCF3P0C7M6 154 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 ACTN1P12814 892 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 ITGB5P18084 799 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 RPS6KB1P23443 525 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 ICAM3P32942 547 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 TAP1Q03518 808 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 TCTN1Q2MV58 587 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 KCNV1Q6PIU1 500 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 SESTD1Q86VW0 696 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 GPR20Q99678 358 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 COG5Q9UP83 839 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 BDP1A6H8Y1 2624 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 XIRP2A4UGR9 3374 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 SPDYE3A6NKU9 549 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 PITPNM1O00562 1244 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 NOP56O00567 594 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 DTNBO60941 627 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 REC8O95072 547 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 TGFB3P10600 412 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 GPNMBQ14956 572 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 RETREG2Q8NC44 543 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 CYP2W1Q8TAV3 490 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 PHKBQ93100 1093 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 HLA-CQ95604 372 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 UIMC1Q96RL1 719 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 KATNAL1Q9BW62 490 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP11.47□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 SIP14410 1827 aa11.46□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 KIF28PB7ZC32 967 aa11.46□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 H3BRB1 525 aa11.46□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 NBNO60934 754 aa11.46□□□□□ -0.57
TIMM50-208ENST00000597552 PPFIA4O75335 1185 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms