RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		5.23	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	ARVCF	O00192	962 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	SLC27A2	O14975	620 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	LTF	P02788	710 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	CYP2C8	P10632	490 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	BMP7	P18075	431 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	ITGA1	P56199	1179 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	GABRE	P78334	506 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	PRR31	Q5SQ13	230 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	LIPI	Q6XZB0	460 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	C20orf173	Q96LM9	149 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	KCNJ15	Q99712	375 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	PIF1	Q9H611	641 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	DTL	Q9NZJ0	730 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COX11-208	ENST00000576084	AQP7	O14520	342 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	KCNQ2	O43526	872 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	CRTAM	O95727	393 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	EPHA5	P54756	1037 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	SLURP1	P55000	103 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	ADAM9	Q13443	819 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	SQSTM1	Q13501	440 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	RTP5	Q14D33	572 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	TEPP	Q6URK8	271 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	DPH6	Q7L8W6	267 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	STK32C	Q86UX6	486 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	SYT8	Q8NBV8	401 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	SCLY	Q96I15	445 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	AMY2A	P04746	511 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	INHBB	P09529	407 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	KCNA6	P17658	529 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	AMY2B	P19961	511 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	HOXA5	P20719	270 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	THBS2	P35442	1172 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	PAK1	Q13153	545 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	TUSC3	Q13454	348 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	NFE2L2	Q16236	605 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	KY	Q8NBH2	561 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	CBLC	Q9ULV8	474 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	ACOT7	O00154	380 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	KRIT1	O00522	736 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	CKM	P06732	381 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	GNAT1	P11488	350 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	GUCY1A3	Q02108	690 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	ALG1	Q9BT22	464 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	NES	P48681	1621 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	SCRIB	Q14160	1630 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	RASGRP1	O95267	797 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	PYGM	P11217	842 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	FAH	P16930	419 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	NKX3-2	P78367	333 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	GRIN1	Q05586	938 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	LILRA6	Q6PI73	481 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	CARF	Q8N187	725 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	FBXW5	Q969U6	566 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	SPATA25	Q9BR10	227 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COX11-208	ENST00000576084	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58

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