RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567620.1

CHTF18-217, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-217ENST00000567620 ITGB5P18084 799 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 RBM25P49756 843 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 SEMA3FQ13275 785 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 TMEM240Q5SV17 173 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 C16orf59Q7L2K0 433 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 OTOP2Q7RTS6 562 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 FAM161BQ96MY7 647 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 TBC1D32Q96NH3 1257 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 SENP7Q9BQF6 1050 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 ANO3Q9BYT9 981 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 WNT8AQ9H1J5 351 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 JADE2Q9NQC1 790 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 MYH7BA7E2Y1 1941 aa17.08■□□□□ 0.33
CHTF18-217ENST00000567620 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 LGALS2P05162 132 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 IFNAR1P17181 557 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 GNA11P29992 359 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 SESTD1Q86VW0 696 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 TEX2Q8IWB9 1127 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 GPR20Q99678 358 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 MXRA8Q9BRK3 442 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 C16orf70Q9BSU1 422 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 ZBBXA8MT70 800 aa17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 MAFGO15525 162 aa17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 ATP9AO75110 1047 aa17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 EVCP57679 992 aa17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 NLRP5P59047 1200 aa17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 ANAPC15P60006 121 aa17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 AP3B2Q13367 1082 aa17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 PKN1Q16512 942 aa17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 ZNF697Q5TEC3 545 aa17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 SDF4Q9BRK5 362 aa17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 C17orf102A2RUQ5 167 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 HAS3O00219 553 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 IQCF3P0C7M6 154 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 NTRK3Q16288 839 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 MCTP2Q6DN12 878 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 CCDC148Q8NFR7 591 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 BICD2Q8TD16 824 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 SEPT1Q8WYJ6 367 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 GLG1Q92896 1179 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 IL17RAQ96F46 866 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 ZMYND12Q9H0C1 365 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 KCNH7Q9NS40 1196 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 VPS54Q9P1Q0 977 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 PITPNM1O00562 1244 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 ACTN1P12814 892 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 KCNA2P16389 499 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 ARHGAP4P98171 946 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 ANKRD1Q15327 319 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 CEP55Q53EZ4 464 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 TRIM50Q86XT4 487 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 CYP2W1Q8TAV3 490 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 CAGE1Q8TC20 777 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 HERVK_113Q902F9 699 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 ATP6V0A1Q93050 837 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 TELO2Q9Y4R8 837 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 NID2Q14112 1375 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 ESYT2A0FGR8 921 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 GRXCR1A8MXD5 290 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 PFKMP08237 780 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 ARP10275 920 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 GNAT1P11488 350 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 SELPP16109 830 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 RFC2P35250 354 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 SREBF1P36956 1147 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 PTK7Q13308 1070 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 PLA2G4DQ86XP0 818 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 AFAP1L1Q8TED9 768 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 SETD4Q9NVD3 440 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 CDKL5O76039 1030 aa17.03■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 DEXIO95424 95 aa17.03■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 MARK3P27448 753 aa17.03■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 CLK2P49760 499 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 LRRC8DQ7L1W4 858 aa17.03■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 RASGRP4Q8TDF6 673 aa17.03■□□□□ 0.32
CHTF18-217ENST00000567620 UIMC1Q96RL1 719 aa17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms