RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 NECAB1Q8N987 351 aa21.59■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.59■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 BICD2Q8TD16 824 aa21.59■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 IL17RAQ96F46 866 aa21.59■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.59■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 JADE2Q9NQC1 790 aa21.59■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.59■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.58■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 SREBF1P36956 1147 aa21.58■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 EPHB4P54760 987 aa21.58■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 CCL23P55773 120 aa21.58■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 ARHGAP4P98171 946 aa21.58■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 SHHQ15465 462 aa21.58■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.58■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 TMEM199Q8N511 208 aa21.58■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 AIFM3Q96NN9 605 aa21.58■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.58■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.58■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.58■■□□□ 1.05
USP10-208ENST00000563386 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 F2P00734 622 aa21.57■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 LGALS2P05162 132 aa21.57■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 CSF2RAP15509 400 aa21.57■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 KCNA2P16389 499 aa21.57■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 PTGISQ16647 500 aa21.57■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 MCTP2Q6DN12 878 aa21.57■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 GPR20Q99678 358 aa21.57■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.57■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.57■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 LARGE1O95461 756 aa21.56■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 ARP10275 920 aa21.56■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.043e-8■■□□□ 14.4
USP10-208ENST00000563386 ME3Q16798 604 aa21.56■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 CEP55Q53EZ4 464 aa21.56■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 LRCH3Q96II8 777 aa21.56■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 UIMC1Q96RL1 719 aa21.56■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.56■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.56■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 H3BRB1 525 aa21.55■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 MAFGO15525 162 aa21.55■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 ACRP10323 421 aa21.55■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 TRIM50Q86XT4 487 aa21.55■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 HAS3O00219 553 aa21.54■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.54■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 RETREG2Q8NC44 543 aa21.54■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 SCLYQ96I15 445 aa21.54■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 SDF4Q9BRK5 362 aa21.54■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.54■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.54■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.54■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 MEIS1O00470 390 aa21.53■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 CTDNEP1O95476 244 aa21.53■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 SESTD1Q86VW0 696 aa21.53■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 GTF3C6Q969F1 213 aa21.53■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.53■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 FAM86B1E9PN63 330 aa21.52■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 CYP3A4P08684 503 aa21.52■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.52■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.52■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 BLIDQ8IZY5 108 aa21.52■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.52■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.041e-7■□□□□ 8.9
USP10-208ENST00000563386 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.52■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
USP10-208ENST00000563386 STK36Q9NRP7 1315 aa21.52■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.51■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.51■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.51■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 XBP1P17861 261 aa21.51■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 BFSP2Q13515 415 aa21.51■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 ZNF365Q70YC5 407 aa21.51■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.51■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.51■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.51■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.51■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 GLG1Q92896 1179 aa21.51■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 IL23AQ9NPF7 189 aa21.51■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.51■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.5■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 PRR16Q569H4 304 aa21.5■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 TMEM240Q5SV17 173 aa21.5■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.5■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.5■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 KIF2CQ99661 725 aa21.5■■□□□ 1.03
USP10-208ENST00000563386 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms