RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554340.1

NEMP1-204, Transcript of nuclear envelope integral membrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEMP1, Length 1,381 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.63■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 TMEM87BQ96K49 555 aa23.63■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.63■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 KAT6AQ92794 2004 aa23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 LCHNA4D1U4 455 aa23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 CCDC69A6NI79 296 aa23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 H3BRB1 525 aa23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 PRC1O43663 620 aa23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 GJB5O95377 273 aa23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 LGALS2P05162 132 aa23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 SMARCA1P28370 1054 aa23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 HOXC8P31273 242 aa23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 NEDD9Q14511 834 aa23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 METTL7BQ6UX53 244 aa23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.62■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.61■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 FIBPO43427 364 aa23.61■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 LGR5O75473 907 aa23.61■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 CALM1P0DP23 149 aa23.61■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 CALM2P0DP24 149 aa23.61■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 CALM3P0DP25 149 aa23.61■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 GRB10Q13322 594 aa23.61■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 AAK1Q2M2I8 961 aa23.61■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 KRT40Q6A162 431 aa23.61■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 SPRED2Q7Z698 418 aa23.61■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 MYL10Q9BUA6 226 aa23.61■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 SLC27A2O14975 620 aa23.6■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 LPXNO60711 386 aa23.6■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa23.6■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.6■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 THPOP40225 353 aa23.6■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 TFF2Q03403 129 aa23.6■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 SEMA3FQ13275 785 aa23.6■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.6■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 CUL5Q93034 780 aa23.6■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.6■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 RAD9AQ99638 391 aa23.6■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 USP26Q9BXU7 913 aa23.6■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.59■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 PIK3CDO00329 1044 aa23.59■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 RSPH10BP0C881 870 aa23.59■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.59■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.59■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.59■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.59■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.59■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.59■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 MEIS2O14770 477 aa23.58■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 NECTIN1Q15223 517 aa23.58■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 GPR20Q99678 358 aa23.58■■□□□ 1.37
NEMP1-204ENST00000554340 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 TREHO43280 583 aa23.57■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 BMP1P13497 986 aa23.57■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 LIFRP42702 1097 aa23.57■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.57■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.57■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.57■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 COG5Q9UP83 839 aa23.57■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.57■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 CAND2O75155 1236 aa23.56■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.56■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 ERVK-21P61565 698 aa23.56■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.56■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 LINC01553A4QN01 128 aa23.55■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 AMHP03971 560 aa23.55■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 GNAT1P11488 350 aa23.55■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.55■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.55■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.364e-6■■■■□ 19.9
NEMP1-204ENST00000554340 TRIM50Q86XT4 487 aa23.55■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.55■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.55■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.54■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 KCNQ1P51787 676 aa23.54■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 NLRX1Q86UT6 975 aa23.54■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 SETD4Q9NVD3 440 aa23.54■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.54■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 RXRAP19793 462 aa23.53■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 SEPT8Q92599 483 aa23.53■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 HLA-CQ95604 372 aa23.53■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.53■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.53■■□□□ 1.36
NEMP1-204ENST00000554340 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.53■■□□□ 1.36
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