RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490540.1

ASIC3-208, Transcript of acid sensing ion channel subunit 3, human

TSL 2

Gene ASIC3, Length 520 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASIC3-208	ENST00000490540	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	WNT8B	Q93098	351 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	TGFB3	P10600	412 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	SP4	Q02446	784 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	TAP1	Q03518	808 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	BFSP2	Q13515	415 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	SPRED2	Q7Z698	418 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	SLC9A7	Q96T83	725 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	MYH6	P13533	1939 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	ZBTB43	O43298	467 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	FIBP	O43427	364 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	PPFIA4	O75335	1185 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	LGALS2	P05162	132 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	NEFL	P07196	543 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	ICAM3	P32942	547 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	RFC2	P35250	354 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	GPNMB	Q14956	572 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	RTN1	Q16799	776 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	REV3L	O60673	3130 aa		13.77	□□□□□ -0.2
ASIC3-208	ENST00000490540	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	STAM2	O75886	525 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	CKB	P12277	381 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	SELP	P16109	830 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	CDC27	P30260	824 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	FUT2	Q10981	343 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	GRB10	Q13322	594 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	TCTN1	Q2MV58	587 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	HLA-C	Q95604	372 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	GPR20	Q99678	358 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	COG5	Q9UP83	839 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540		H3BRB1	525 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	TLL1	O43897	1013 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	NBN	O60934	754 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	ATP9A	O75110	1047 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	ITGB5	P18084	799 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	KCNJ6	P48051	423 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	NAPA	P54920	295 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	PTK7	Q13308	1070 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	NEDD9	Q14511	834 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	KRT32	Q14532	448 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	NLRX1	Q86UT6	975 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	LCHN	A4D1U4	455 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ASIC3-208	ENST00000490540	LPXN	O60711	386 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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