RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480000.5

APOBEC3G-204, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 2

Gene APOBEC3G, Length 812 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-204ENST00000480000 LY9Q9HBG7 655 aa14.68□□□□□ -0.06
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APOBEC3G-204ENST00000480000 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 LINC01553A4QN01 128 aa14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 CAND2O75155 1236 aa14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 LGALS2P05162 132 aa14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 AAK1Q2M2I8 961 aa14.67□□□□□ -0.06
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APOBEC3G-204ENST00000480000 GPR20Q99678 358 aa14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 USP26Q9BXU7 913 aa14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 EMSYQ7Z589 1322 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.66□□□□□ -0.06
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APOBEC3G-204ENST00000480000 RSPH10BP0C881 870 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 KCNQ1P51787 676 aa14.66□□□□□ -0.06
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APOBEC3G-204ENST00000480000 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 RPAINQ86UA6 219 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 ERICH2A1L162 156 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.65□□□□□ -0.06
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APOBEC3G-204ENST00000480000 DDAH1O94760 285 aa14.65□□□□□ -0.06
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APOBEC3G-204ENST00000480000 NECTIN1Q15223 517 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 GNPTABQ3T906 1256 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.65□□□□□ -0.06
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APOBEC3G-204ENST00000480000 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 HLA-CQ95604 372 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 TOP1MTQ969P6 601 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-204ENST00000480000 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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APOBEC3G-204ENST00000480000 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 COL4A6Q14031 1691 aa14.63□□□□□ -0.07
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APOBEC3G-204ENST00000480000 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 ATP9AO75110 1047 aa14.63□□□□□ -0.07
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APOBEC3G-204ENST00000480000 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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