RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 KRIT1O00522 736 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 GNAT1P11488 350 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 THBS2P35442 1172 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 NKX3-2P78367 333 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 TUSC3Q13454 348 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 RTP5Q14D33 572 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 SP8Q8IXZ3 490 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 LILRB2Q8N423 598 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 KYQ8NBH2 561 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 PTPRN2Q92932 1015 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 ALG1Q9BT22 464 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 CD244Q9BZW8 370 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 NTMQ9P121 344 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 GUCY1A3Q02108 690 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 PROSER1Q86XN7 944 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 DSEQ9UL01 958 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 AQP7O14520 342 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 CRTAMO95727 393 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 PAK1Q13153 545 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 PRR31Q5SQ13 230 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 MCTP2Q6DN12 878 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 FERMT3Q86UX7 667 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 MKL1Q969V6 931 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNK3O14649 394 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 NOBOXO60393 691 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 MAFKO60675 156 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 RASGRP1O95267 797 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 PYGMP11217 842 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 GABREP78334 506 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 SOGA3Q5TF21 947 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 DPH6Q7L8W6 267 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 TTLL6Q8N841 843 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 RELTQ969Z4 430 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 CROTQ9UKG9 612 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 CBLCQ9ULV8 474 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 ACOT7O00154 380 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 ARVCFO00192 962 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 AMY2AP04746 511 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 PDE6AP16499 860 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 KRT15P19012 456 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 AMY2BP19961 511 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 NFIXQ14938 502 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 KCTD1Q719H9 257 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 OSTM1Q86WC4 334 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 JMYQ8N9B5 988 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-206ENST00000467748 SCLYQ96I15 445 aa6.24□□□□□ -1.41
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