RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 PFASO15067 1338 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 KCTD2Q14681 263 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 E2F4Q16254 413 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 ECM1Q16610 540 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 CABP7Q86V35 215 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 FGD4Q96M96 766 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 KCND1Q9NSA2 647 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 ATP9AO75110 1047 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 FCER1AP12319 257 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 CASP1P29466 404 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 JADE2Q9NQC1 790 aa20.86■□□□□ 0.93
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CAPN3-209ENST00000466222 TBX3O15119 743 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 CHMP2AO43633 222 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 CCND2P30279 289 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 MTMR1Q13613 665 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 PDIA5Q14554 519 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 AK8Q96MA6 479 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 FAM20AQ96MK3 541 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 EML1O00423 815 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 PSMD10O75832 226 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 PRR29P0C7W0 189 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 APLP1P51693 650 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 INHBEP58166 350 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 NLRP12P59046 1061 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 PNOCQ13519 176 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 SLC5A5Q92911 643 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 TM4SF4P48230 202 aa20.84■□□□□ 0.93
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CAPN3-209ENST00000466222 CRHR2Q13324 411 aa20.84■□□□□ 0.93
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CAPN3-209ENST00000466222 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 DNERQ8NFT8 737 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 CAPNS2Q96L46 248 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 MTRQ99707 1265 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 DISC1Q9NRI5 854 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 CREBZFQ9NS37 354 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 COBLO75128 1261 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 BCRP11274 1271 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 TNNT1P13805 278 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 PLCG1P19174 1290 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 ADORA2AP29274 412 aa20.84■□□□□ 0.93
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CAPN3-209ENST00000466222 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 PNMA5Q96PV4 448 aa20.84■□□□□ 0.93
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CAPN3-209ENST00000466222 COPB2P35606 906 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 TXLNAP40222 546 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPN3-209ENST00000466222 RASSF10A6NK89 507 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPN3-209ENST00000466222 GAS7O60861 476 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPN3-209ENST00000466222 SLFN14P0C7P3 912 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPN3-209ENST00000466222 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPN3-209ENST00000466222 ISM2Q6H9L7 571 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPN3-209ENST00000466222 C17orf99Q6UX52 265 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPN3-209ENST00000466222 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.92
CAPN3-209ENST00000466222 KCNK18Q7Z418 384 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPN3-209ENST00000466222 RAB34Q9BZG1 259 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPN3-209ENST00000466222 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.82■□□□□ 0.92
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