RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 CREG2Q8IUH2 290 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 KCNMA1Q12791 1236 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC181Q5TID7 509 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 SLURP2P0DP57 97 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 CRKP46108 304 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 RASSF7Q02833 373 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 DCAF4Q8WV16 495 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 NOX5Q96PH1 765 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.23■□□□□ 0.83
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SYNE4-204ENST00000465425 SLC26A4O43511 780 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 TCP10Q12799 353 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 ZSCAN26Q16670 478 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 SLFN13Q68D06 897 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 COG1Q8WTW3 980 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 MYH4Q9Y623 1939 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 NPR1P16066 1061 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 CYP11B2P19099 503 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 ALDH1B1P30837 517 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 PSMB7Q99436 277 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 FAM196BA6NMK8 535 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 SERPING1P05155 500 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 ITIH3Q06033 890 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 AP3B2Q13367 1082 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 HGSNATQ68CP4 663 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.21■□□□□ 0.83
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SYNE4-204ENST00000465425 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 DNAJC18Q9H819 358 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 AFF2P51816 1311 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 CAPN2P17655 700 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 STAT3P40763 770 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 PAFAH1B1P43034 410 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 CACNB3P54284 484 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 ADAM9Q13443 819 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 ERMNQ8TAM6 284 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 NYAP2Q9P242 653 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-204ENST00000465425 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 CYP3A7P24462 503 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 CXCR5P32302 372 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 MOXD1Q6UVY6 613 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 MKL1Q969V6 931 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 POTEFA5A3E0 1075 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 BUB1O43683 1085 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 MED24O75448 989 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 NOL4O94818 638 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 POTEIP0CG38 1075 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGAP4P98171 946 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 PRR16Q569H4 304 aa20.2■□□□□ 0.82
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