RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
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PRAME-210ENST00000442481 REC8O95072 547 aa13.44□□□□□ -0.26
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PRAME-210ENST00000442481 MBTPS1Q14703 1052 aa13.44□□□□□ -0.26
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PRAME-210ENST00000442481 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.268e-7■□□□□ 9.2
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PRAME-210ENST00000442481 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
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PRAME-210ENST00000442481 EP400NLQ6ZTU2 488 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-210ENST00000442481 HOMER1Q86YM7 354 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-210ENST00000442481 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-210ENST00000442481 PIBF1Q8WXW3 757 aa13.43□□□□□ -0.26
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