RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359175.8

SPTSSB-201, Transcript of serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTSSB, Length 3,103 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSB-201ENST00000359175 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 IFT43Q96FT9 208 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 PNMA2Q9UL42 364 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 CYP27B1O15528 508 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 SNX3O60493 162 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 RAPGEF3O95398 923 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 FLT3P36888 993 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 CASP7P55210 303 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 PLS1Q14651 629 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 SCFD2Q8WU76 684 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 PALMO75781 387 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 BAG3O95817 575 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 MYBPC3Q14896 1274 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 RTN1Q16799 776 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 HOOK3Q86VS8 718 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 PHF24Q9UPV7 400 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.55□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 NLRP6P59044 892 aa14.54□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 KLC1Q07866 573 aa14.54□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 COPS6Q7L5N1 327 aa14.54□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.54□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 BCL9O00512 1426 aa14.54□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 ACADSP16219 412 aa14.54□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 PCK1P35558 622 aa14.54□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 SCNN1BP51168 640 aa14.54□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.54□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 PGM2Q96G03 612 aa14.54□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 ZPR1O75312 459 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 PDE6CP51160 858 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 TMEM154Q6P9G4 183 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 KIF2BQ8N4N8 673 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 FBF1Q8TES7 1133 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 KIFAP3Q92845 792 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 SLX1AQ9BQ83 275 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 ZWILCHQ9H900 591 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 USP54Q70EL1 1684 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 CALB2P22676 271 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 KRT2P35908 639 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 SLC1A4P43007 532 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 NAB2Q15742 525 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 NBPF15Q8N660 670 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 VCXQ9H320 206 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.53□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 A0A087WZG4 1122 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 WNT7AO00755 349 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 FTCDO95954 541 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 FOXO4P98177 505 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 PTGDRQ13258 359 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 SEC14L1Q92503 715 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 GOPCQ9HD26 462 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 CREB3O43889 395 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 CCNB1P14635 433 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 CD151P48509 253 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 ZNF174Q15697 407 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms