RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 DGKZQ13574 1117 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 CEP135Q66GS9 1140 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 CNGA4Q8IV77 575 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF507Q8TCN5 953 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC5A5Q92911 643 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 SYT17Q9BSW7 474 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 PANK4Q9NVE7 773 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 FRMD3A2A2Y4 597 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 POTEFA5A3E0 1075 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 MFAP3LO75121 409 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 PSMD10O75832 226 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 GYPCP04921 128 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 POTEIP0CG38 1075 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 FECHP22830 423 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 CEP55Q53EZ4 464 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 POTEGQ6S5H5 508 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 RPTORQ8N122 1335 aa23.93■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 TPM1P09493 284 aa23.93■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP2R5CQ13362 524 aa23.93■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.93■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 GPBP1Q86WP2 473 aa23.93■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 MB21D1Q8N884 522 aa23.93■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 DNM3Q9UQ16 869 aa23.93■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.93■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 MEIS1O00470 390 aa23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 DNM2P50570 870 aa23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 UBXN1Q04323 297 aa23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 NFIBO00712 420 aa23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 ALAS1P13196 640 aa23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM26FQ5R3K3 315 aa23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 CPXCR1Q8N123 301 aa23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.421e-9■■■■■ 42.5
SNRNP25-201ENST00000293861 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 ZSCAN12O43309 604 aa23.91■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 MUTP22033 750 aa23.91■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 CASP14P31944 242 aa23.91■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 ARSHQ5FYA8 562 aa23.91■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 CREBRFQ8IUR6 639 aa23.91■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.91■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 EML1O00423 815 aa23.9■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 VWA5AO00534 786 aa23.9■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.9■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.9■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.9■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 FZD1Q9UP38 647 aa23.9■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 BCRP11274 1271 aa23.9■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.9■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.9■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.89■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 DYNC1I1O14576 645 aa23.89■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 OAZ1P54368 228 aa23.89■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 HMGCS2P54868 508 aa23.89■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 PSMC6P62333 389 aa23.89■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 REXO1L1PQ8IX06 675 aa23.89■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.89■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF20AO95235 890 aa23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 EYA4O95677 639 aa23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.88■■□□□ 1.418e-7■□□□□ 9.9
SNRNP25-201ENST00000293861 UBXN2AP68543 259 aa23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 ZCWPW2Q504Y3 356 aa23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 CPLX3Q8WVH0 158 aa23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 ATG4CQ96DT6 458 aa23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 TSG101Q99816 390 aa23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 COL20A1Q9P218 1284 aa23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 GIT2Q14161 759 aa23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 RIT2Q99578 217 aa23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 GAS7O60861 476 aa23.87■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 DSG3P32926 999 aa23.87■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 MIIPQ5JXC2 388 aa23.87■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.87■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRC55Q6ZSA7 311 aa23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms