RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 FAAP100Q0VG06 881 aa25.39■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 DGKDQ16760 1214 aa25.39■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa25.39■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 TBCKQ8TEA7 893 aa25.39■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 LENG9Q96B70 501 aa25.39■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 GPR20Q99678 358 aa25.39■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SYF2-201ENST00000236273 USP11P51784 963 aa25.38■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 FAM126BQ8IXS8 530 aa25.38■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa25.38■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 C16orf70Q9BSU1 422 aa25.38■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 PDLIM7Q9NR12 457 aa25.38■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.38■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 TRIM43BA6NCK2 446 aa25.37■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 CD4P01730 458 aa25.37■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 SYN1P17600 705 aa25.37■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 ZNF76P36508 570 aa25.37■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 MCM2P49736 904 aa25.37■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 NBPF20Q3BBV1 942 aa25.37■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 KRT40Q6A162 431 aa25.37■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G4DQ86XP0 818 aa25.37■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 HAS3O00219 553 aa25.37■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 DHX15O43143 795 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 MMP1P03956 469 aa25.37■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 NR5A1Q13285 461 aa25.37■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 NFASCO94856 1347 aa25.36■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa25.36■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.36■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 F2P00734 622 aa25.36■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 ZNF286BP0CG31 522 aa25.36■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 CYP3A7P24462 503 aa25.36■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 ITGB8P26012 769 aa25.36■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 FOSBP53539 338 aa25.36■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.36■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa25.36■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 FAM205CA6NFA0 338 aa25.35■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 BTBD18B2RXH4 712 aa25.35■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 INF2Q27J81 1249 aa25.35■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 MBOAT7Q96N66 472 aa25.35■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 LGALS2P05162 132 aa25.34■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 CLTBP09497 229 aa25.34■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 KRT2P35908 639 aa25.34■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 PSEN2P49810 448 aa25.34■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 SP4Q02446 784 aa25.34■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 PRR16Q569H4 304 aa25.34■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 NFRKBQ6P4R8 1299 aa25.34■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 UIMC1Q96RL1 719 aa25.34■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 TRPV6Q9H1D0 765 aa25.34■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 TBX21Q9UL17 535 aa25.34■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 MROH7Q68CQ1 1323 aa25.33■■□□□ 1.65
SYF2-201ENST00000236273 DCDC2CA8MYV0 355 aa25.33■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0355O15063 1070 aa25.33■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 B4GALT4O60513 344 aa25.33■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 TDP2O95551 362 aa25.33■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 GUCY1B3Q02153 619 aa25.33■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.33■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 SEPT1Q8WYJ6 367 aa25.33■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 PRO3102Q9H379 93 aa25.33■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.33■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 CCNE2O96020 404 aa25.32■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 MFSD10Q14728 455 aa25.32■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 Q4G0T1 1027 aa25.32■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 MOXD1Q6UVY6 613 aa25.32■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 SESTD1Q86VW0 696 aa25.32■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa25.32■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 CTAGE1Q96RT6 745 aa25.32■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 PCYT2Q99447 389 aa25.32■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 LTBP2Q14767 1821 aa25.31■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.31■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 MSH4O15457 936 aa25.31■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 ATG7O95352 703 aa25.31■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 CUL4AQ13619 759 aa25.31■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 HIC1Q14526 733 aa25.31■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.31■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 TRIM50Q86XT4 487 aa25.31■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 C8orf76Q96K31 380 aa25.31■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 GDF15Q99988 308 aa25.31■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.31■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 TMEM39AQ9NV64 488 aa25.31■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 H3BRB1 525 aa25.3■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 TRIM29Q14134 588 aa25.3■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 SDF4Q9BRK5 362 aa25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms