RNA–Protein interactions for RNA: YOL072W

THP1, Transcript of Nuclear pore-associated protein, yeast

Gene THP1, Length 1,368 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THP1	YOL072W	GIC1	P38785	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	YHR218W	P38899	603 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	FAA3	P39002	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	DSS1	P39112	969 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	YEL073C	P39974	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	YNL140C	P53910	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	MPS1	P54199	764 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	TGL2	P54857	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	SMA1	Q02651	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	IRC15	Q02733	499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	MMT1	Q03218	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	PSR1	Q07800	427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	NSE1	Q07913	336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	OPI10	Q08202	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	SEC39	Q12745	709 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	AI3	P03877	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	ATR1	P13090	542 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	PRI2	P20457	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	PEX3	P28795	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	SEC17	P32602	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	YME2	P32843	850 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	CBP4	P37267	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	COS111	P38308	924 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	FTH1	P38310	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	MTW1	P39731	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	AZF1	P41696	914 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	GAB1	P41733	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	ELP2	P42935	788 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	AIM22	P47051	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	RMR1	P53060	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	MON1	P53129	644 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	SNO2	P53823	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	UGO1	Q03327	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	VHS1	Q03785	461 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	PEX12	Q04370	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	GPI11	Q06636	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	ATG29	Q12092	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	UNG1	P12887	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	TRX3	P25372	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	NTG1	P31378	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	EMC3	P36039	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	GLG1	P36143	616 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	AIM46	P38885	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	SWD1	P39706	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	SNL1	P40548	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	MPH1	P40562	993 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
THP1	YOL072W	YFR020W	P43600	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	MET12	P46151	657 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	BIR1	P47134	954 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	COS12	P53053	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	SGF73	P53165	657 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	DSL1	P53847	754 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	YNL095C	P53932	642 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	YKU80	Q04437	629 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	DAL4	Q04895	635 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	VPS68	Q12016	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	MLH3	Q12083	715 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	DAP1	Q12091	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	GPR1	Q12361	961 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	TIM9	O74700	87 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	RAP1	P11938	827 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	DAP2	P18962	818 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	MRPS28	P21771	286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	CMK2	P22517	447 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	RML2	P32611	393 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	TFB1	P32776	642 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	SPC42	P36094	363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	SPC34	P36131	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	YBR241C	P38142	488 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP1	YOL072W	YBR071W	P38243	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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