RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W PEX18P38855 283 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W IMA5P40884 581 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SNZ3P43545 298 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YGR017WP53210 297 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SNZ2P53824 298 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W EMI1Q04406 187 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W APC4Q04601 652 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W FRE6Q12473 712 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W HKR1P41809 1802 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W MET17P06106 444 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W KRE6P32486 720 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W UGP1P32861 499 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SSN3P39073 555 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ORC5P50874 479 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YNL146WP53906 100 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W VTC3Q02725 835 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W GMC1Q04399 608 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W MGR3Q04472 501 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SNO4Q04902 237 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W BRE4Q07660 1125 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W HSP33Q08914 237 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W HSP32Q08992 237 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RPB4P20433 221 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W LAS1P36146 502 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W REV7P38927 245 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TIM17P39515 158 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W DUO1P53168 247 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YGR066CP53242 292 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data2.76□□□□□ -1.97not detected
SIN3YOL004W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SOG2Q08817 791 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TCO89Q08921 799 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W Q0144Q9ZZW2 109 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W COX1P00401 534 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W NIP100P33420 868 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SWD1P39706 426 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W AVT7P40501 490 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W LSC2P53312 427 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W OAZ1Q02803 292 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ATG10Q07879 167 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SCH9P11792 824 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ROX1P25042 368 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SPC110P32380 944 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ERG1P32476 496 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W KES1P35844 434 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W AGP2P38090 596 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data2.76□□□□□ -1.97not detected
SIN3YOL004W PRP39P39682 629 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ARB1P40024 610 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W CFD1P40558 293 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W LSC1P53598 329 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SED5Q01590 340 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W LOT6Q07923 191 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W IES4Q08561 116 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YIG1Q08956 461 aa2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YEL076C-AP0CX16 216 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YLR464WP0CX17 216 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SAC7P17121 654 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W CKI1P20485 582 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W UBA1P22515 1024 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W VPS17P32913 551 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W MEF2P39677 819 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YEL076CP39971 216 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W AAD15Q08361 143 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W AIM41Q12032 185 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RPP2AP05319 106 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SAM35P14693 329 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W CKA2P19454 339 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W DAD2P36162 133 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RKM3P38222 552 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W PUG1P40100 303 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W AAD14P42884 376 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W MTR3P48240 250 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W DBP6P53734 629 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RTC5Q12108 567 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W MET8P15807 274 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W OLE1P21147 510 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W NNK1P36003 928 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YPT52P36018 234 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W FIG1P38224 298 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W AIM3P38266 947 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W KTR6P54070 446 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W CMS1Q07897 291 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W LAA1P39526 2014 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W PET111P08468 800 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W CDC6P09119 513 aa2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W HEM13P11353 328 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
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