RNA–Protein interactions for RNA: YNR067C

DSE4, Transcript of Daughter cell-specific secreted protein with similarity to glucanases, yeast

Gene DSE4, Length 3,354 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSE4	YNR067C	YNL181W	P53878	407 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	YMR160W	Q03823	816 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	YDR109C	Q04585	715 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	VPS74	Q06385	345 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	ATG31	Q12421	196 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	RAD3	P06839	778 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	CBF1	P17106	351 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	ZRC1	P20107	442 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	PBN1	P25580	416 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	ZIP1	P31111	875 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	VHC1	P38329	1120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	RTT107	P38850	1070 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	FET3	P38993	636 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	PCL6	P40038	420 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	TAX4	P47030	604 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	CUZ1	P53899	274 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	AAC1	P04710	309 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	GAC1	P28006	793 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	AIM29	P36154	155 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	IML3	P38265	245 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	PCA1	P38360	1216 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	SIC1	P38634	284 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	CEM1	P39525	442 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	YER130C	P39959	443 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	YEL020C	P39994	560 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	LOH1	P47055	219 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	NRG1	Q03125	231 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	PLB2	Q03674	706 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	COQ9	Q05779	260 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	YDL176W	Q12027	708 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	YLL053C	P0CD98	152 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	UTR1	P21373	530 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	CMK2	P22517	447 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	ELO2	P25358	347 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	CIN8	P27895	1000 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	LHS1	P36016	881 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	ELO1	P39540	310 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	ECM1	P39715	212 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	HXT9	P40885	567 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	MRPL50	P53724	139 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.72	□□□□□ -1.97	not detected
DSE4	YNR067C	VAC7	P53950	1165 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	HXT11	P54862	567 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	UBP16	Q02863	499 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	MRP51	Q02950	344 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	ECM11	Q04110	302 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	NNT1	Q05874	261 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	SHS1	Q07657	551 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	PAM18	Q07914	168 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	INP53	Q12271	1107 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	YPR1	Q12458	312 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	ZPS1	Q12512	249 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	NFT1	P0CE68	1218 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.72	□□□□□ -1.97	RIP-Chip
DSE4	YNR067C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	YSP3	P25036	478 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	YSC83	P32792	385 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	BCS1	P32839	456 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	LDB7	P38210	180 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	PTC7	P38797	343 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	GPI16	P38875	610 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	SNZ3	P43545	298 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	SAD1	P43589	448 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	MTL1	P53214	551 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	SNZ2	P53824	298 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	SPP2	Q02521	185 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	IVY1	Q04934	453 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	OPT2	Q06593	877 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	POS5	Q06892	414 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	SYO1	Q07395	620 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	CYK3	Q07533	885 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	RAX1	Q08760	435 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	MET3	P08536	511 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	CHS2	P14180	963 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	GPI12	P23797	304 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	RHB1	P25378	209 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	CDC20	P26309	610 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
DSE4	YNR067C	FMP33	P46998	180 aa		2.72	□□□□□ -1.97

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