RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN11	YML043C	MAL12	P53341	584 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PRM1	P53835	661 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SRT1	Q03175	343 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RSN1	Q03516	953 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SPC19	Q03954	165 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	BCH1	Q05029	724 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	DCR2	Q05924	578 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	FMP45	Q07651	309 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YOL019W	Q08157	551 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ALE1	Q08548	619 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	FRE3	Q08905	711 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	THI21	Q08975	551 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ACM1	Q08981	209 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	APC1	P53886	1748 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CBF1	P17106	351 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	EXO70	P19658	623 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	UTR1	P21373	530 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CTR86	P25355	563 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PTC6	P25646	442 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	NDI1	P32340	513 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	DAL3	P32459	195 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	NDC1	P32500	655 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SCM4	P32564	187 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SEF1	P34228	1148 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PTC1	P35182	281 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PHO11	P35842	467 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	EMC3	P36039	253 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	TSC10	P38342	320 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PHO12	P38693	467 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SPC97	P38863	823 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	AIM18	P38884	321 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ERV46	P39727	415 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YRB2	P40517	327 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	VHR1	P40522	640 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
RRN11	YML043C	CAF16	P43569	289 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YJR096W	P47137	282 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ASE1	P50275	885 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ORC5	P50874	479 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	NMA2	P53204	395 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YTP1	P53584	459 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	OCA2	P53949	197 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	TGL2	P54857	326 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ARP4	P80428	489 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CWC27	Q02770	301 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	GAL83	Q04739	417 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YLR173W	Q06247	608 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ARG80	P07249	177 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SPS4	P09937	338 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SLY1	P22213	666 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PPH22	P23595	377 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CPR4	P25334	318 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PTP2	P29461	750 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	HMX1	P32339	317 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	NUP2	P32499	720 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RPC25	P35718	212 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	NNK1	P36003	928 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YKL151C	P36059	337 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MRPL3	P36516	390 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	POP4	P38336	279 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YHR054C	P38780	354 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PLB1	P39105	664 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RGI2	P40188	164 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	UBP7	P40453	1071 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MAD2	P40958	196 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	HXT14	P42833	540 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PAC10	P48363	199 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YDL183C	P48569	320 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YBP2	P53169	641 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YNL034W	P53963	612 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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