RNA–Protein interactions for RNA: YLL003W

SFI1, Transcript of Centrin (Cdc31p)-binding protein required for SPB duplication, yeast

Gene SFI1, Length 2,841 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFI1	YLL003W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	AAC3	P18238	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	DCC1	P25559	380 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	BZZ1	P38822	633 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	UIP3	P39547	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RBG1	P39729	369 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	BUR6	P40096	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	LSB6	P42951	607 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	CSN12	P47130	423 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	MRK1	P50873	501 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	DOC1	P53068	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	LSC2	P53312	427 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	CSC1	Q06538	782 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	LDB18	Q07887	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	INP53	Q12271	1107 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	GLO4	Q12320	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SEM1	O94742	89 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	CDC50	P25656	391 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RPC25	P35718	212 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	AGP2	P38090	596 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ECM8	P38246	354 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	FMC1	P40491	155 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	NAS2	P40555	220 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MRPS18	P42847	217 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YGR201C	P42936	225 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	IRC5	P43610	853 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YJR030C	P47101	745 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PUS6	P53294	404 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	VPS75	P53853	264 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	AAT1	Q01802	451 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MRP51	Q02950	344 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ROY1	Q04847	553 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	TGL5	Q12043	749 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YPT6	Q99260	215 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SRD1	P09007	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SPS4	P09937	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PHO13	P19881	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
SFI1	YLL003W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ECM25	P32525	599 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	DOA1	P36037	715 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SHG1	P38337	142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PFD1	P46988	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PMT5	P52867	743 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	TCO89	Q08921	799 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RCN2	Q12044	265 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
SFI1	YLL003W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MRP13	P12686	339 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	NPR1	P22211	790 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YBR284W	P38150	797 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	HXT13	P39924	564 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SAM37	P50110	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ERV14	P53173	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	VPS62	P53285	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ERG5	P54781	538 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	TRS31	Q03337	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	TOS4	Q06266	489 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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