RNA–Protein interactions for RNA: YJL209W

CBP1, Transcript of Mitochondrial protein, regulator of COB mRNA stability and translation, yeast

Gene CBP1, Length 1,965 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBP1	YJL209W	WHI2	P12611	486 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	SHP1	P34223	423 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	TAE1	P38340	232 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	YHR122W	P38829	231 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	GAT2	P40209	560 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	YHC3	P47040	408 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	SPT20	P50875	604 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	NSE1	Q07913	336 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	YPR089W	O13585	888 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	HXT2	P23585	541 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
CBP1	YJL209W	FRE1	P32791	686 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	RRN10	P38204	145 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	PIH1	P38768	344 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	SPC97	P38863	823 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	CDC1	P40986	491 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	MSS2	P40990	351 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	PIB2	P53191	635 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	VOA1	P53262	265 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	YTP1	P53584	459 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	APC4	Q04601	652 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	SOR2	Q07786	357 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	THP1	Q08231	455 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CBP1	YJL209W	RAP1	P11938	827 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
CBP1	YJL209W	GID7	P25569	745 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	BUD2	P33314	1104 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YKR073C	P36153	106 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	STP2	P38704	541 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	ALP1	P38971	573 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YPS6	P40583	537 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SPG5	P42933	373 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	RIM8	P53179	542 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SRL4	Q03085	281 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	RDR1	Q08904	546 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	FMP16	Q12497	93 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	RMD5	Q12508	421 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	CLB2	P24869	491 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YUR1	P26725	428 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YJL070C	P40361	888 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	TOS3	P43637	560 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	GIM3	P53900	129 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	URC2	Q04411	772 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	MDM36	Q06820	579 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	AFT2	Q08957	416 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	RUP1	Q12242	671 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	MED4	Q12343	284 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	MAS1	P10507	462 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YPS1	P32329	569 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	ATP11	P32453	318 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	KRE6	P32486	720 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	ECM25	P32525	599 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	MSN2	P33748	704 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	MIA40	P36046	403 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	RCY1	P39531	840 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SYG1	P40528	902 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	PAC11	P40960	533 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SAS2	P40963	338 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YFL015C	P43578	164 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	PHO86	P46956	311 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	PET117	Q02771	107 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	TMA10	Q06177	86 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	ECM7	Q06200	448 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	PEP5	P12868	1029 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SUA5	P32579	426 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	RTT107	P38850	1070 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	MIT1	P40002	666 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	TDA10	P42938	290 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	MRK1	P50873	501 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	PFA5	Q03289	374 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CBP1	YJL209W	SUT2	Q12286	268 aa		4.75	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47.6 ms