RNA–Protein interactions for RNA: YFL007W

BLM10, Transcript of Proteasome activator, yeast

Gene BLM10, Length 6,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLM10	YFL007W	RAD30	Q04049	632 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PRM4	Q12498	284 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MET17	P06106	444 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YCL068C	P25593	260 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	BMT2	P38278	337 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MLH1	P38920	769 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	EAF5	P39995	279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SMK1	P41808	388 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	IKS1	P47042	667 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CYK3	Q07533	885 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ESA1	Q08649	445 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MET3	P08536	511 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HYM1	P32464	399 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SLC1	P33333	303 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MRPL37	P36532	105 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RPA43	P46669	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MET13	P53128	600 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YNR062C	P53748	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SLD7	Q08457	257 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RAX1	Q08760	435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SPE1	P08432	466 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CCE1	Q03702	353 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YFT2	Q06676	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	FDH1	Q08911	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	NUS1	Q12063	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
BLM10	YFL007W	PHO5	P00635	467 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	STE18	P18852	110 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ETR1	P38071	380 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SRO77	P38163	1010 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PRM9	P39551	298 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	QDR1	P40475	563 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SSU1	P41930	458 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	AAD14	P42884	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	QRI7	P43122	407 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MEC3	Q02574	474 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YML079W	Q03629	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SPS4	P09937	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	FUS1	P11710	512 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	UGA1	P17649	471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ERG5	P54781	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GLO2	Q05584	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PNP1	Q05788	311 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	EST2	Q06163	884 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GUD1	Q07729	489 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HMG2	P12684	1045 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ARG8	P18544	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TVP38	P36164	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GDH3	P39708	457 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YEL057C	P39983	233 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SDP1	P40479	209 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	COX5B	P00425	151 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	NAM2	P11325	894 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YBR220C	P38318	560 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ALT2	P52892	507 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GPG1	P53130	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YGR127W	P53275	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SPP2	Q02521	185 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SAC7	P17121	654 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SFL1	P20134	766 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	NFS1	P25374	497 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	NUP2	P32499	720 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PCA1	P38360	1216 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ALG8	P40351	577 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CFD1	P40558	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	THI12	P42883	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	THI5	P43534	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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