RNA–Protein interactions for RNA: YAL058W

CNE1, Transcript of Calnexin, yeast

Gene CNE1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CNE1	YAL058W	MDM36	Q06820	579 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	UIP4	Q08926	304 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	TRM10	Q12400	293 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	SNF8	Q12483	233 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	ENA5	Q12691	1091 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	MHF1	Q3E835	90 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	RHB1	P25378	209 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	MRPL9	P31334	269 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	SFP1	P32432	683 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	ADD66	P36040	267 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	SEA4	P38164	1038 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	HEM14	P40012	539 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	JLP2	P40206	208 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	ALG8	P40351	577 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	PET130	P47065	347 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	SNF12	P53628	566 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	YDR444W	Q04093	687 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	PPN1	Q04119	674 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	ARP10	Q04549	284 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	TOR1	P35169	2470 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CNE1	YAL058W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	SDH3	P33421	198 aa		5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	SCD5	P34758	872 aa		5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	CTF13	P35203	478 aa		5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	LDB7	P38210	180 aa		5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	YHR078W	P38799	552 aa		5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.84	□□□□□ -1.48	not detected
CNE1	YAL058W	YEL020C	P39994	560 aa		5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	FAR7	P43592	221 aa		5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	MSE1	P48525	536 aa		5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	MRX6	P48564	524 aa		5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	CAF120	P53836	1060 aa		5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	YMR206W	Q03695	313 aa		5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	ECM11	Q04110	302 aa		5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	GSH2	Q08220	491 aa		5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	RIB3	Q99258	208 aa		5.84	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	VPS33	P20795	691 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	MRPL40	P36534	297 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	ARN2	P38724	620 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	MTG2	P38860	518 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	DUN1	P39009	513 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	CEM1	P39525	442 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	COG3	P40094	801 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	OSW5	P40219	148 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	GAB1	P41733	394 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	BIR1	P47134	954 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	FLC3	P53121	802 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	PEX13	P80667	386 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	MFB1	Q04922	465 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	PEX10	Q05568	337 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	MCP2	Q06567	569 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	MFG1	Q07684	458 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	YLR012C	Q07927	99 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	YLR126C	Q12288	251 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	GLE1	Q12315	538 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	MDM12	Q92328	271 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	FRT1	Q99332	602 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	STT4	P37297	1900 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	HIR2	P32480	875 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	PPG1	P32838	368 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	THI80	P35202	319 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	STB6	P36085	766 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	ALY1	P36117	915 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	EXO1	P39875	702 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	GTS1	P40956	396 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	MET12	P46151	657 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	AIM23	P47015	356 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	AMA1	P50082	593 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	COG1	P53079	417 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	SDH1	Q00711	640 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	YML053C	Q04978	212 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	NUT2	Q06213	157 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	ARR1	Q06596	294 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CNE1	YAL058W	THP1	Q08231	455 aa		5.82	□□□□□ -1.48

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