RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	IDS2	P46958	469 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	YIP5	P53108	310 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	PUS2	P53167	370 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	RET3	P53600	189 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	BUD17	P53727	317 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	IPI3	P53877	555 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	YLR455W	Q06188	304 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	LOA1	Q06508	300 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	FMP16	Q12497	93 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	MTR10	Q99189	972 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	RSR1	P13856	272 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	URA4	P20051	364 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	ACH1	P32316	526 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	SIP1	P32578	815 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	TAF14	P35189	244 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	COS9	P36034	407 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	SAS2	P40963	338 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	YFR018C	P43599	363 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	PHO86	P46956	311 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	UBP16	Q02863	499 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	INP2	Q03824	705 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	URH1	Q04179	340 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	SUT2	Q12286	268 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	YDR262W	Q12331	272 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	RKM5	Q12367	367 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	CHS1	P08004	1131 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ATP10	P18496	279 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	CTR86	P25355	563 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	NTH1	P32356	751 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	COT1	P32798	439 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	EMP70	P32802	667 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ELF1	P36053	145 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	WSS1	P38838	269 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ERV46	P39727	415 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	IRC8	P47046	822 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ASI1	P54074	624 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	RNT1	Q02555	471 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	CDC123	Q05791	360 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	SGO1	Q08490	590 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	AIM41	Q12032	185 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	LAG2	Q92325	660 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YML133C	Q03099	1374 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YLL066C	Q99208	1374 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	HXT2	P23585	541 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	IMG1	P25626	169 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	HXT1	P32465	570 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	LIP5	P32875	414 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YKL187C	P34231	750 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	OCT1	P35999	772 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	SIP3	P38717	1229 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	SIM1	P40472	476 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YJR154W	P47181	346 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	TIS11	P47977	285 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YTP1	P53584	459 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	BIO4	P53630	237 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	NUP116	Q02630	1113 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	FMP30	Q02883	468 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ASA1	Q06822	443 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	AEP3	Q12089	606 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	MSN2	P33748	704 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YCH1	P42937	148 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	GLG2	P47011	380 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	SPT20	P50875	604 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	MKC7	P53379	596 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	PGA2	P53903	129 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ARK1	P53974	638 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	BET4	Q00618	327 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	IRC13	Q08630	104 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ITR1	P30605	584 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98

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