RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613947.1

CCL4-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 4, humanhuman

Gene CCL4, Length 1,774 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4-201ENST00000613947 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.64□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.64□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.64□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 SREBF1P36956 1147 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 MCTP2Q6DN12 878 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 OXER1Q8TDS5 423 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 CEP290O15078 2479 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 STAM2O75886 525 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 ITGB5P18084 799 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 ARHGAP4P98171 946 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 CUL4AQ13619 759 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 LY6KQ17RY6 165 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 KRT40Q6A162 431 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 COPS5Q92905 334 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 DYNC1I1O14576 645 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 ADAMTS4O75173 837 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 GJA9P57773 515 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 SP2Q02086 613 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 GUCY1B3Q02153 619 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 TRIM29Q14134 588 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 LRRC41Q15345 812 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 GNPTABQ3T906 1256 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 TLK2Q86UE8 772 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 C8orf76Q96K31 380 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 FRMPD3Q5JV73 1810 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 MYADML2A6NDP7 307 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 CTAGE5O15320 804 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 MMP1P03956 469 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 CAPN2P17655 700 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 GJB2P29033 226 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 SEMA3FQ13275 785 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 RNF180Q86T96 592 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 Q9Y3F1 56 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 BTBD18B2RXH4 712 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 EDIL3O43854 480 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 CYP3A4P08684 503 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 TGFB3P10600 412 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 ICAM3P32942 547 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 KRT2P35908 639 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 NR5A1Q13285 461 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 CEP55Q53EZ4 464 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 NLRX1Q86UT6 975 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 TBCKQ8TEA7 893 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 SPC25Q9HBM1 224 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 FAM86B1E9PN63 330 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 DNM1LO00429 736 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 FIBPO43427 364 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 ZNF76P36508 570 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 BEX3Q00994 111 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 GNASQ5JWF2 1037 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 JADE2Q9NQC1 790 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 MEIS1O00470 390 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 SORBS3O60504 671 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 NKX3-2P78367 333 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 MTMR1Q13613 665 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
CCL4-201ENST00000613947 KCNA10Q16322 511 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms