RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 SYN1P17600 705 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 GNA11P29992 359 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF76P36508 570 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 CPT1AP50416 773 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 FOSBP53539 338 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 RTP1P59025 263 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 LAMC2Q13753 1193 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 RABEP1Q15276 862 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNV1Q6PIU1 500 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 NLRX1Q86UT6 975 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC83Q8IWF9 413 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 RASGRP4Q8TDF6 673 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 AFG1LQ8WV93 481 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 GTF3C6Q969F1 213 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 GLT1D1Q96MS3 346 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 UIMC1Q96RL1 719 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 ANO3Q9BYT9 981 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 MLXIPQ9HAP2 919 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 STARD7Q9NQZ5 370 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 SH3GLB2Q9NR46 395 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 GJB4Q9NTQ9 266 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNJ14Q9UNX9 436 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.78□□□□□ -1.16
EFTUD2-211ENST00000588374 ESYT2A0FGR8 921 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 ST18O60284 1047 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 JAK2O60674 1132 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP9AO75110 1047 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 GGPS1O95749 300 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 TGFB3P10600 412 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 FDPSP14324 419 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 ITGB5P18084 799 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 CST5P28325 142 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 PSMC6P62333 389 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 NKX3-2P78367 333 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 TLE2Q04725 743 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGAP1Q07960 439 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 GNPTABQ3T906 1256 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM60Q495X7 471 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 MCTP2Q6DN12 878 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 XRRA1Q6P2D8 792 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 BLIDQ8IZY5 108 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP2W1Q8TAV3 490 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 BICD2Q8TD16 824 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA33Q96N06 139 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 MXRA8Q9BRK3 442 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 ALG1Q9BT22 464 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 JADE2Q9NQC1 790 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 FRMPD4Q14CM0 1322 aa7.77□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 A6NJR5 290 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 ARVCFO00192 962 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 FIBPO43427 364 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 KPNA6O60684 536 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 CABYRO75952 493 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 ARP10275 920 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 XBP1P17861 261 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 ICAM3P32942 547 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 CDK7P50613 346 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGAP4P98171 946 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 PURAQ00577 322 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 SP4Q02446 784 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 ST3GAL1Q11201 340 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 SEMA3FQ13275 785 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 AP3B2Q13367 1082 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 ITGA7Q13683 1181 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 NEDD9Q14511 834 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 DGKDQ16760 1214 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 HSDL1Q3SXM5 330 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 WASF1Q92558 559 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 BRCA2P51587 3418 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 GRIN2DO15399 1336 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 ELP1O95163 1332 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 STK36Q9NRP7 1315 aa7.76□□□□□ -1.17
EFTUD2-211ENST00000588374 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.5 ms