RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 MFSD10Q14728 455 aa21.14■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 GPNMBQ14956 572 aa21.14■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.14■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 TMTC2Q8N394 836 aa21.14■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 C7orf31Q8N865 590 aa21.14■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa21.14■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 TMEM87BQ96K49 555 aa21.14■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 SPATA33Q96N06 139 aa21.14■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.14■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 SLC27A2O14975 620 aa21.13■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 STAM2O75886 525 aa21.13■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 BAIAP3O94812 1187 aa21.13■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 ZNF286BP0CG31 522 aa21.13■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 MYOGP15173 224 aa21.13■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 SELPP16109 830 aa21.13■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 ICAM3P32942 547 aa21.13■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 MCM5P33992 734 aa21.13■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 CASC1Q6TDU7 716 aa21.13■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.13■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.13■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 ALG1Q9BT22 464 aa21.13■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 LIFRP42702 1097 aa21.12■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 NECTIN1Q15223 517 aa21.12■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 PPP2R2DQ66LE6 453 aa21.12■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.12■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.12■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 MYL10Q9BUA6 226 aa21.12■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.12■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 CHD7Q9P2D1 2997 aa21.12■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 PTPRSQ13332 1948 aa21.12■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 PIK3CDO00329 1044 aa21.11■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 CXCL10P02778 98 aa21.11■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 CKBP12277 381 aa21.11■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 GNAQP50148 359 aa21.11■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 PTK7Q13308 1070 aa21.11■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.11■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.11■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.11■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 GNPTABQ3T906 1256 aa21.1■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.1■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 CCDC69A6NI79 296 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 MEIS2O14770 477 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 SORBS3O60504 671 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 CA3P07451 260 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 CALM1P0DP23 149 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 CALM2P0DP24 149 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 CALM3P0DP25 149 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 HOXC8P31273 242 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 SEMA3FQ13275 785 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 HIC1Q14526 733 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 XRRA1Q6P2D8 792 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 WNT8BQ93098 351 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 FIBPO43427 364 aa21.08■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 NBNO60934 754 aa21.08■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 NEDD9Q14511 834 aa21.08■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.08■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.08■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.08■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.08■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 CUL5Q93034 780 aa21.08■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.08■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.08■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 PRDM6Q9NQX0 595 aa21.08■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 H3BRB1 525 aa21.07■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 LGALS2P05162 132 aa21.07■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 IGFBP4P22692 258 aa21.07■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 KCNJ6P48051 423 aa21.07■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 WDR5P61964 334 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 METTL7BQ6UX53 244 aa21.07■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 SERINC5Q86VE9 423 aa21.07■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.07■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.07■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 KIF28PB7ZC32 967 aa21.06■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 RXRAP19793 462 aa21.06■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 TJAP1Q5JTD0 557 aa21.06■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.06■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 PPM1EQ8WY54 764 aa21.06■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.06■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 USP26Q9BXU7 913 aa21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms