RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-205ENST00000586027 USP11P51784 963 aa35.74■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 NLRX1Q86UT6 975 aa35.74■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 FRMPD3Q5JV73 1810 aa35.73■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 FIBPO43427 364 aa35.73■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 TDP2O95551 362 aa35.73■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 PGK1P00558 417 aa35.73■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP35.73■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 BCAS3Q9H6U6 928 aa35.73■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa35.73■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 OGDHLQ9ULD0 1010 aa35.73■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa35.73■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 ARP10275 920 aa35.72■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 PDCP20941 246 aa35.72■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 MTMR1Q13613 665 aa35.72■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 NEK8Q86SG6 692 aa35.72■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 NOSTRINQ8IVI9 506 aa35.72■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 LENG9Q96B70 501 aa35.72■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 WNT7AO00755 349 aa35.71■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 ATP9AO75110 1047 aa35.71■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 LETM2Q2VYF4 491 aa35.71■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 MCTP1Q6DN14 999 aa35.71■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 TLK2Q86UE8 772 aa35.71■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 KCNH7Q9NS40 1196 aa35.71■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 MYADML2A6NDP7 307 aa35.7■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 CTAGE5O15320 804 aa35.7■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 ADAMTS4O75173 837 aa35.7■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 KCNV1Q6PIU1 500 aa35.7■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 NIPA1Q7RTP0 329 aa35.7■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 PLA2G4DQ86XP0 818 aa35.7■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
GIPC1-205ENST00000586027 SORBS3O60504 671 aa35.69■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 TGFB3P10600 412 aa35.69■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 EN2P19622 333 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 SOX10P56693 466 aa35.69■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 ARHGAP1Q07960 439 aa35.69■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 PRR16Q569H4 304 aa35.69■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 UIMC1Q96RL1 719 aa35.69■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 PKD2L1Q9P0L9 805 aa35.69■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa35.68■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP35.68■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 TFRCP02786 760 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 KCNA2P16389 499 aa35.68■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 CYP3A7P24462 503 aa35.68■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 GJA9P57773 515 aa35.68■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 MBOAT7Q96N66 472 aa35.68■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa35.68■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 Q9Y3F1 56 aa35.68■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 OR6J1Q8NGC5 347 aa35.67■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 CDHR1Q96JP9 859 aa35.67■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 MTMR6Q9Y217 621 aa35.67■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 GGPS1O95749 300 aa35.66■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 LRRC41Q15345 812 aa35.66■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 MOXD1Q6UVY6 613 aa35.66■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 MAFGO15525 162 aa35.65■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 SLC37A4O43826 429 aa35.65■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 GH1P01241 217 aa35.65■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 Q4G0T1 1027 aa35.65■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 TELO2Q9Y4R8 837 aa35.65■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 STX6O43752 255 aa35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 NKX3-2P78367 333 aa35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 BEX3Q00994 111 aa35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 MYSM1Q5VVJ2 828 aa35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 FERMT3Q86UX7 667 aa35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 KLHDC9Q8NEP7 349 aa35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 SENP7Q9BQF6 1050 aa35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 AP5M1Q9H0R1 490 aa35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 ATP2B1P20020 1258 aa35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 SETQ01105 290 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 PPP4R3AQ6IN85 833 aa35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 CYFIP1Q7L576 1253 aa35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-205ENST00000586027 MSH4O15457 936 aa35.63■■■■□ 3.29
GIPC1-205ENST00000586027 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
GIPC1-205ENST00000586027 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
GIPC1-205ENST00000586027 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
GIPC1-205ENST00000586027 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
GIPC1-205ENST00000586027 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
GIPC1-205ENST00000586027 NEDD9Q14511 834 aa35.62■■■■□ 3.29
GIPC1-205ENST00000586027 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
GIPC1-205ENST00000586027 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
GIPC1-205ENST00000586027 AFG1LQ8WV93 481 aa35.62■■■■□ 3.29
GIPC1-205ENST00000586027 GJA10Q969M2 543 aa35.62■■■■□ 3.29
GIPC1-205ENST00000586027 DOCK5Q9H7D0 1870 aa35.61■■■■□ 3.29
GIPC1-205ENST00000586027 CST5P28325 142 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
GIPC1-205ENST00000586027 PKP1Q13835 747 aa35.61■■■■□ 3.29
GIPC1-205ENST00000586027 NBR1Q14596 966 aa35.61■■■■□ 3.29
GIPC1-205ENST00000586027 RNF180Q86T96 592 aa35.61■■■■□ 3.29
GIPC1-205ENST00000586027 ARRDC4Q8NCT1 418 aa35.61■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms