RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574026.2

ITGAE-209, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 3

Gene ITGAE, Length 416 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-209ENST00000574026 SPINT1O43278 529 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 RAD17O75943 681 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 SMC2O95347 1197 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 PLEKHA8P1O95397 391 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 MMP1P03956 469 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 SKILP12757 684 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 SCG2P13521 617 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 ATP1A3P13637 1013 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 TNNT1P13805 278 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 ATP2B1P20020 1258 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 GPC1P35052 558 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 SERPINB4P48594 390 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 CXCL9Q07325 125 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 PKN1Q16512 942 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 PTPN21Q16825 1174 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 LONRF3Q496Y0 759 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 ARMCX5Q6P1M9 558 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 TATDN1Q6P1N9 297 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 KRBA2Q6ZNG9 492 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 CAPN12Q6ZSI9 719 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 TMEM179Q6ZVK1 233 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 TMC6Q7Z403 805 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 NOSTRINQ8IVI9 506 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 TEX2Q8IWB9 1127 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 STAG2Q8N3U4 1231 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 COL26A1Q96A83 441 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 TMEM47Q9BQJ4 181 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 BPIFA3Q9BQP9 254 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 MKNK1Q9BUB5 465 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 MXD3Q9BW11 206 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 SPZ1Q9BXG8 430 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 GLT8D2Q9H1C3 349 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 SH2D4AQ9H788 454 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 IL17RBQ9NRM6 502 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 MTMR4Q9NYA4 1195 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 NYAP2Q9P242 653 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 TMEM232C9JQI7 657 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 KLRF2D3W0D1 207 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 H7C1D1 291 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 FZD9O00144 591 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 NFKBIEO00221 500 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 ADAMTS3O15072 1205 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 NMT2O60551 498 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 GFRA3O60609 400 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 DGAT1O75907 488 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 UPP2O95045 317 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 LMNB1P20700 586 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 BMP6P22004 513 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 GNA11P29992 359 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 SHMT1P34896 483 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 KRT2P35908 639 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 TRAPPC10P48553 1259 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 FANCCQ00597 558 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 GOLGA8FQ08AF8 430 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 TCP10Q12799 353 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 NFIAQ12857 509 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 ABCB5Q2M3G0 1257 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 MCTP2Q6DN12 878 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 USP49Q70CQ1 688 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 SLC44A5Q8NCS7 719 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 DCAF4Q8WV16 495 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 MKL1Q969V6 931 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGAE-209ENST00000574026 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms