RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 VWCEQ96DN2 955 aa24.19■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 SPATA33Q96N06 139 aa24.19■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.462e-10■■■□□ 16.7
PPP4C-211ENST00000567642 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa24.19■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.19■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 CALM1P0DP23 149 aa24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 CALM2P0DP24 149 aa24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 CALM3P0DP25 149 aa24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 SMARCA1P28370 1054 aa24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 LIFRP42702 1097 aa24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 SP2Q02086 613 aa24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 RNF20Q5VTR2 975 aa24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 SESTD1Q86VW0 696 aa24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 TGFB3P10600 412 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 RABGGTBP53611 331 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 HSDL1Q3SXM5 330 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 GNPTABQ3T906 1256 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 SLC28A3Q9HAS3 691 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 PPFIA4O75335 1185 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 USP17L6PQ6QN14 398 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 CAGE1Q8TC20 777 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 CDH23Q9H251 3354 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 F2P00734 622 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 MICU3Q86XE3 530 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 KAT6AQ92794 2004 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.14■■□□□ 1.46
PPP4C-211ENST00000567642 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.14■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 HAS3O00219 553 aa24.14■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 STAM2O75886 525 aa24.14■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 FANCBQ8NB91 859 aa24.14■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.14■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 NEK1Q96PY6 1258 aa24.14■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 NOP56O00567 594 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 CDC45O75419 566 aa24.13■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 MYOGP15173 224 aa24.13■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.13■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa24.13■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 PTPRSQ13332 1948 aa24.12■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 PIK3CDO00329 1044 aa24.12■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 MEIS2O14770 477 aa24.12■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 SELPP16109 830 aa24.12■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 NEDD9Q14511 834 aa24.12■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC8DQ7L1W4 858 aa24.12■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.12■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.12■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 EYSQ5T1H1 3165 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 FIBPO43427 364 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 CKBP12277 381 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 ICAM3P32942 547 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 PTK7Q13308 1070 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 PPP2R2DQ66LE6 453 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 CYFIP1Q7L576 1253 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 UNC80Q8N2C7 3258 aa24.1■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 IGFBP4P22692 258 aa24.1■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 SEMA3FQ13275 785 aa24.1■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.1■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 NLRX1Q86UT6 975 aa24.1■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 PPM1EQ8WY54 764 aa24.1■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 SLC9A7Q96T83 725 aa24.1■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 H3BRB1 525 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 LGALS2P05162 132 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 SP4Q02446 784 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 UBE2SQ16763 222 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 METTL7BQ6UX53 244 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 RASEFQ8IZ41 740 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 PARNO95453 639 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 KCNJ6P48051 423 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 RBL2Q08999 1139 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 HIC1Q14526 733 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 APOA5Q6Q788 366 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4C-211ENST00000567642 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms