RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563854.1

NME3-205, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 5

Gene NME3, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-205ENST00000563854 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 ZNF576Q9H609 170 aa20.38■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.38■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 MSRAQ9UJ68 235 aa20.38■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.38■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 SCN5AQ14524 2016 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 F2P00734 622 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 SMARCA1P28370 1054 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 FANCBQ8NB91 859 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 PITPNM1O00562 1244 aa20.36■□□□□ 0.85
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NME3-205ENST00000563854 IQCF3P0C7M6 154 aa20.36■□□□□ 0.85
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NME3-205ENST00000563854 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 RAB30Q15771 203 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 SESTD1Q86VW0 696 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 RASEFQ8IZ41 740 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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NME3-205ENST00000563854 TGFB3P10600 412 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 ACTN1P12814 892 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 RFC2P35250 354 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 SP4Q02446 784 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 UBE2SQ16763 222 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 APOA5Q6Q788 366 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 VWCEQ96DN2 955 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 MEIS2O14770 477 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 FIBPO43427 364 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 STAM2O75886 525 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 CAGE1Q8TC20 777 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 GBF1Q92538 1859 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 HAS3O00219 553 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 PIK3CDO00329 1044 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 ZBTB43O43298 467 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 PPFIA4O75335 1185 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 FGD1P98174 961 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 KRT32Q14532 448 aa20.33■□□□□ 0.85
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NME3-205ENST00000563854 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 LRRC8DQ7L1W4 858 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-205ENST00000563854 CDH23Q9H251 3354 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 GOLGA8AA7E2F4 631 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 DLL1O00548 723 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 MYOGP15173 224 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 SEMA3FQ13275 785 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 NEDD9Q14511 834 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 LGALS2P05162 132 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 CKBP12277 381 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 CPA1P15085 419 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 SELPP16109 830 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 ICAM3P32942 547 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 METTL7BQ6UX53 244 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 NLRX1Q86UT6 975 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 EYSQ5T1H1 3165 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 H3BRB1 525 aa20.3■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 NAPAP54920 295 aa20.3■□□□□ 0.84
NME3-205ENST00000563854 PTK7Q13308 1070 aa20.3■□□□□ 0.84
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